疱疹性咽峡炎是由病毒感染引起的，等病毒得到了控制，身体的温度也会恢复正常。一般情况下一周左右要进行抗病毒治疗，日常生活中要注意个人卫生。检查血液常规，对症处理，如果体温过高，可以使用退热贴，也可以遵医嘱口服退热的药物。
多喝水，在日常生活中可以让孩子多吃些清淡的东西。平时要保持口腔的卫生，可以用淡盐水漱口。
可以使用抗病毒药物治疗，疱疹性咽峡炎是由于疱疹病毒感染引起的咽峡部炎症，是具有传染性的，所以首先要做好消毒隔离，避免到人多的公共场所。同时饮食上增强营养，多吃一些鸡蛋，鱼虾，瘦肉等富含蛋白的食物。
疱疹性咽峡炎，高烧反复发烧，可以考虑把酒精沾在毛巾上，然后不断的敷身体，因为酒精的蒸发需要吸收热量，会带走身上的温度，所以温度就会下降，用普通的饮用水也可以，但是效果没有酒精好，如果担心刺激到病人的身体，可以把酒精兑水之后再敷在身上，就不会有太大的事情。
小儿疱疹性咽峡进行抗病毒及消炎治疗，儿童疱疹性咽峡炎主要是由于疱疹病毒感染引起的传染性疾病，临床表现会出现咽痛、发热、浑身乏力、食欲减退等症状。如果口服用药效果不佳，需要通过静脉用药。
疱疹性咽峡炎口腔疼痛明显患儿大多都有拒食现象应该注意给患儿补充营养食物不宜过热应该清淡一些不油腻并富有营养进食困难时可以采取大静脉营养合剂。为防止继发感染局部使用止痛剂和抗病毒药物一定注意口腔卫生患儿用过的食具一定要进行沸水消毒处理避免造成感染。
疱疹性咽峡炎后期会咳嗽，咳嗽是人体清除呼吸道内的分泌物或异物的保护性呼吸反射动作一般由感冒引起。得了疱疹性咽峡炎不会有咳嗽反应。虽然感冒与疱疹性咽峡炎均属于急性上呼吸道感染但疱疹性咽峡炎的病灶主要在于咽、软腭、悬雍垂(口腔中软腭后缘正中悬垂的小圆锥体。