婴儿的肠道在从无菌到建立一个正常菌群的过程中，有可能会遭遇到细菌比例不调的情况，婴儿的肠道内的气体就会比较多，所以能常听到幼儿肚子咕噜咕噜响，有的甚至会频繁地放屁，只有尽快帮助婴儿建立一个细菌比例正常，生态平衡的正常菌群环境，让益生菌占据主要地位，就会自然改善。
一般情况下，新生儿宝宝肚子总是咕噜咕噜响可能是肠胃功能不完善、进食频率高等导致的，这是一种正常的生理反应。具体原因如下：
1、婴幼儿肠胃功能不完善，产生的消化酶活性低，肠胃不和谐，进食后会有肚子的响声；
2、新生儿进食频率高，进食时不可避免的会吸入一些空气，造成肠胃胀气，造成新生儿腹胀、哭闹等症状。而且哭声还会加剧肠胃的胀气，引起肠鸣。
新生婴儿，反复出现肠鸣音活跃，这可能与消化不良、饮食不当引起的胃肠功能紊乱有关。婴儿胃肠消化吸收能力较弱，很容易受到外界不良刺激影响胃肠消化吸收功能，可以服用益生菌调节肠道菌群治疗，合理喂养，少量多餐哺乳，避免外界不良刺激。
考虑是肠胀气，出生之后很多事情都需要熟悉，对于吸吮都是需要相互磨合才能完成吃奶这种事情，那么在还不习惯的时候吃奶时总是会吸进去空气，有时候饿了的时候着急吃奶也会吸进去空气，这样肚子里面就会产生肠胀气，发出叽里咕噜的响声，家长不用理会，一段时间就会自行缓解的。
新生儿夜间哭闹肚子咕噜咕噜响是因为婴儿肠痉挛，表现为持续的、难以安抚的哭闹，可伴有呕吐、面颊潮红、腹部胀而紧张、翻滚、双腿向上蜷起等症状，这些症状可因肛门排气或排便而缓解，在小婴儿则可反复发作并呈自限过程。给孩子抚慰，摇动孩子，减低环境噪音，用热水袋捂婴儿腹部缓解。
进食之后听到肚子咕噜咕噜的响，这种症状是属于肠蠕动的声音，绝大多数是正常的，当肠道有炎症的时候，炎症刺激肠道粘膜会引起肠蠕动加强，会出现肠鸣音亢进。如果没有腹泻，排出的大便没有消化不良的奶瓣子就可以了，没什么问题。