要解决口腔卫生问题，按照正确的方法刷牙，把牙缝中的食物残渣都刷掉。如果有感染，可使用专业药物，也可使用漱口水，要通过合理饮食调理肠胃，还要经常运动，提高免疫力，以保持肠胃、口腔中的菌群平衡。
一般对于厌氧菌感染的患者，如果是体表部位的厌氧菌感染，需要开放创口，如将创口切开引流，并且将脓液引出。另外，局部注意用双氧水擦拭消毒之后，再用生理盐水或者蒸馏水冲洗，再用碘伏消毒覆盖无菌辅料或者创可贴。
口腔厌氧菌感染首先需要给予抗感染药物治疗，另外还需要注意口腔的卫生。特别是给予盐水的冲洗，以及给予刷牙治疗改善口腔卫生的情况，另外还需要注意有没有全身性的病变，比如糖尿病，会引起这种感染的情况。
妇科阴道厌氧菌感染的症状，有一部分人是没有任何症状，有症状的女性主要表现为阴道分泌物增多，有腥臭味，有时会有外阴瘙痒或烧灼感。分泌物是灰白色，稀薄而不粘稠。确诊后要按疗程，规范治疗，细菌性阴道病容易复发，应及时看医生，对症治疗。
厌氧菌感染人体后可引起多个部位感染，如呼吸道、肠道、泌尿系统、腹腔感染、胆道感染等，且多继发于基础病或免疫力低下者。本身无特异症状，症状主要为累及器官的症状，发生于中枢神经系统的感染可出现发热、头痛、颅内高压等，发生于呼吸系统的可出现咳嗽、胸闷、咳痰等，发生于肠道的可出现腹泻、腹痛等。
肠道厌氧菌是一类可在无氧条件下生存状态良好，而在有氧条件下生长受抑的细菌。维持细菌生存的能量代谢以无氧发酵的方式进行，能引起人体肠道的感染，在较深的伤口中因为缺氧也常常造成感染。特别是老年体弱者、免疫力低下人群和免疫缺陷的人群均为本病易感人群。