牙菌斑的危害是龋病和牙周病，牙菌斑时间一长会形成牙结石，所以要进行洗牙，可每半年到一年一次。平时配合刷牙，用牙线清洁牙与牙之间缝隙。牙菌斑会引发龋病，龋病俗称“虫牙”，这里的“虫”指菌斑中的细菌。牙菌斑牢固地附着在牙面上，细菌摄入唾液中的糖，分解糖产酸，这些酸会破坏牙齿，最终成洞。
龋齿与牙结石这两个截然不同的概念，基本不需要加以区别。
龋齿表现为牙齿上出现黑色、空洞、牙齿组织软化即龋齿。牙结石为外界细菌、食物残渣、加唾液中钙物质粘结粘附于牙齿表面、或牙龈龈沟中、已矿化或局部矿化组织、该组织为矿物盐质。龋齿与牙结石是两码事，二者截然不同。
龋齿需要补，清除龋坏组织需要补；牙结石需要洗牙齿，超声波震动牙结石是可以洗干净的。
牙龈红肿，出血会完全好转，牙龈发生的萎缩没有办法恢复原位。牙结石刺激牙槽骨发生吸收，牙龈是攀附着牙槽骨进行生长的，没有了牙槽骨，牙龈也会适当的萎缩，附着在退缩的牙槽骨表面。慢性的牙周炎，没有办法通过任何治疗恢复原先的牙槽骨高度，以及牙龈的饱满程度，只可以控制，防止疾病向更严重进行发展。
牙周炎和牙结石是两种截然不同的情况，它是一种炎症，可以通过牙结石来治疗牙周炎。
牙周炎是一种常见的疾病，比如牙周病，因为牙结石，因为牙齿的排列不整齐，会引起牙周组织的感染，从而引起牙槽骨的吸收，牙龈的萎缩，以及牙齿的松动。由于牙结石堆积于牙表面，或是附着于义齿表面，由于口腔内的矿物质盐或口腔内的矿物质盐，会导致牙周炎症。
牙周炎和牙结石原因如下：
牙周炎以慢性牙周炎最为多见，以菌斑为始动因子，即微生物为主要致病因。因此在治疗过程中需要注意保护患者的口腔卫生，防止细菌感染。当然，有全身或部分促进因素，如精神因素、遗传因素等，吸烟或有不良习惯以及创伤不良的修复体、牙结石等。这些都会导致牙周炎发病。如果没有及时治疗就会导致牙龈萎缩，牙齿松动以及牙根吸收等一系列症状，严重影响到患者生活质量。
牙龈萎缩严重，一般是由于慢性牙周炎引起的，治疗上首先要通过龈上洁治和龈下刮治清除牙结石和牙菌斑，术后配合漱口液含漱，牙龈萎缩是不会自行恢复的，如果严重影响美观可以通过手术治疗比如牙龈瓣移植手术或烤瓷牙连冠减小牙缝。