皮肤念珠菌病可采用局部疗法进行治疗。如果是皮肤、口腔或是男性生殖器感染念珠菌可在局部患处进行药物涂擦处理。如果女性的阴道感染念珠菌，可以使用一些栓剂药物进行疾病的治疗，阴道感染念珠菌治疗。
皮肤念珠菌病是由白色念珠菌引起的皮肤、粘膜和内脏感染。治疗要去除致病因素，如糖尿病要同时治疗，大量广谱抗生素、糖皮质激素或免疫抑制剂要考虑停用或更换药物。局部使用抗真菌药建议在饮食中不要吃油炸的辛辣刺激物，主要吃清淡多湿的解毒食品，如山药、薏苡枸杞浸泡水等可服用一些胡椒、鱼腥草、汤剂熏蒸效果好。
皮肤黏膜型念珠菌病的临床表现为皮肤潮红、糜烂等。
皮肤粘膜型念珠菌病主要发生在肥胖、多汗的人身上。患者的肛周，臀部，外阴，皮肤潮红，糜烂，边缘清晰，周围可见红色丘疹水疱或脓疱。如果是免疫缺陷类疾病，可能会出现肉芽肿样改变，而播散型则是全身性粟粒疹。粘膜受损，以鹅口疮最为常见，在颊部、齿龈、上下鄂粘膜表面出现白色的凝块，不易擦去，强行剥开，可见鲜红色的糜烂面。
皮肤黏膜型念珠菌病的临床表现可见于头面部、四肢、甲板等。
1、头面部损伤：头面部皮肤上有明显的红色斑点，并伴有浸润的白色薄膜状鳞屑。
2、四肢损害：有明显的红色斑点，有明显的瘙痒或疼痛，有时会影响到足部，导致溃疡。
3、甲板增厚：甲壳周围有一层浑浊的小片状病变，这种病变会扩散到整个指甲，然后会导致指甲变厚，在甲壳下会有大量的碎屑，还会有甲沟炎、积脓、压痛等症状。
肺念珠菌病的治疗方法有以下几种：第一，积极配合医生治疗原发病，去除导致因素，例如需要停用抗生素糖皮质激素和免疫抑制剂。第二，加强病人的对症治疗，同时还要增强身体的免疫力，出现咳嗽、发热的时候要及时治疗。第三，通过抗真菌药物治疗，例如在医生的指导下应用卡泊芬净或者是酮唑，较为顽固的病人，可以在医生的指导下采用免疫治疗。
儿童念珠菌感染可侵犯消化道，呼吸道，泌尿道等器官，并可引起念珠菌感染和念珠菌血症。
儿童念珠菌病主要表现为粘膜病变，坏死组织，纤维素，大量的菌丝和芽孢，假膜脱落，出现灶性糜烂和出血性溃疡。内脏病变多为肉芽肿，急性播散性病变为灰色的细小脓肿，在病灶内有孢子和假菌丝。周围组织有嗜中性粒细胞和组织细胞，血管受到感染，会出现慢性血管炎变化，容易破裂出血，出现血栓，严重的免疫抑制患者炎症反应比较轻微，只有念珠菌和坏死组织的脓肿。
