直肠炎会有排便异常，多数有便秘、腹泻或便秘腹泻交替出现，血便、粘液便或脓血粘液便，多数有粘液或粘液血便腹痛，可有轻至中度下腹隐痛。肛内感觉异常，直肠炎常有大便不尽，里急后重感，亦可伴有肛内灼热、疼痛等感觉异常。
一般直肠炎伴有浅表糜烂多为溃疡性直肠炎的症状，通常表现为，粘液脓血，便次增多，肛门下坠，腹痛，有时可能滴鲜血。可以使用中药灌肠治疗，配合外用药物治疗，要多吃蔬菜和水果，多喝水。
急性期一般不宜作钡剂检查。而特别注意的是重度溃疡性结肠炎在作钡灌肠时，有诱发肠扩张与穿孔的可能性。钡灌肠对本病的诊断和鉴别诊断有重要价值。临床静止期可作钡灌肠检查，以判断近端结肠病变，需排除克隆病者宜再作全消化道钡餐检查，气钡双重对比法更易发现黏膜浅表病变。
由于引起直肠炎的原因复杂多变，临床症状也有所区别，所以一般采用对因治疗和对症治疗两种治疗方式进行治疗。对因治疗根据患直肠炎的原因不同，针对病因进行治疗，有与肛瘘、痔疮等其他疾病引起的直肠炎，要及时对相关疾病进行治疗，及时去除诱因。对于腹泻，也可使用止泻药进行止泻治疗。
结直肠炎由于病因不明，病程长，反复发作，故在治疗上亦十分困难。可以西药治疗，要看情况使用抗生素等药物调节肠道功能，一个月为一个疗程，得四到五个疗程。也可以用中医中药理气舒肠方治疗，健脾补肾、益气除湿为治本之法也要半年以上的时间。