肠镜下切除息肉是比较安全的。如果息肉距离肛门位置比较远，只能选择在电子结肠镜下进行切除。比较小的，可以用活检钳直接夹除。对于比较大的，可以采用镜下的电刀烧灼，然后送病理学检查。
胃息肉以炎症性，增生性及腺瘤性息肉为主，镜下摘除者以腺瘤性或直径0.5cm以上息肉为主。一般镜下切除术后禁食1～3天，输保护胃黏膜和抑制胃酸分泌药物，平时7天即可达痊愈。
另外镜下切除易发生息肉反复发作，患者需要定期复诊，一般是6个月-1年复诊1次，以免漏诊息肉病变。术后患者要做好护理工作，避免损伤切口或辛辣刺激性食物。
直肠息肉不一定非要通过手术来进行切除。对于一些单发性的，直径为毫米级的良性直肠息肉，可以通过在平常的时候生活习惯的改善，以及控制自己的饮食，能够起到控制病情的作用。如果对于直径接近一厘米或者大于一厘米以上的，需要考虑肠镜下微创手术。
电子肠镜检查疼。也不要过于的担心到专业的医院去进行相关的检查，而且治疗疾病是最重要的，平时的时候还是要注意局部的清洁卫生，一定要养成按时排大便的习惯，而且一定要多吃新鲜的蔬菜水果，尽量避免过于辛辣刺激的食物。没有明确的肠镜检查指征，查肠镜不必要的，单纯想知道肛肠病，宜到医院肛肠科就诊，认为有必要检查时，再进行检查较合适。
息肉分无蒂和有蒂两种，亚蒂息肉是介于有蒂和无蒂之间的，大多数都是良性的，但是如果不积极治疗的话，也是有癌变可能的。通常早期查出亚蒂息肉时就可以通过手术切除来治疗，越尽早治疗效果越好，生成癌症的可能性越小。亚蒂息肉多采用电子肠镜下息肉切除术，切下的组织应该做病理学检查，由于息肉具有一定的恶变倾向，术后应随访，半年至一年后电子肠镜复查。
一般情况下，消化内镜下切除息肉的不良反应可能有出血、穿孔等。具体内容如下：
1.出血：消化内镜下切除息肉，由于会产生创面，因此在息肉被切除后，会出现出血的情况，但出血量通常比较少。
2.穿孔：如果消化内镜下切除息肉时，切除的面积过多，深度过深，且患者没有注意后续的护理工作，可能会导致出现穿孔的情况。