囊肿比较大的需要手术治疗，做手术的时候必须将包膜完整的切除，否则容易导致复发。手术后需要口服药物或者打针进行消炎，半个月后可以拆线。一定要注意休息，不要劳累，注意合理的饮食。
如果是肝脏的囊肿比较小，不需要特别的治疗，可以定时进行检查。但若囊肿大且有挤压感，应立即进行囊肿开窗手术。如有炎症、囊液中有胆汁，应在开窗手术后进行导管引流。若有多囊肝脏的征象，应尽早进行肝脏移植。在日常生活中要注意保持情绪的放松，不要过于紧张和焦躁。另外还要注意多做一些运动，比如慢跑、游泳等，有助于改善症状。
卵巢囊肿可以根据症状及时对症治疗控制，有囊肿暂时不要怀小孩子，在卵巢囊肿好转以后再进行怀小孩子是比较安全的，平时注意情绪调节控制，不用太担心，囊肿不会导致不孕不育。
如果囊肿发生蒂扭转，则有严重腹痛腹胀、呼吸困难、食欲降低、恶心及发热等。较大的囊肿会对膀胱附近造成压迫，引起尿频和排尿困难。一般大于5公分需要手术治疗，五公分一下保守治疗，炎症引起的抗炎治疗后会消失的，一般问题不大，属良性的。
卵巢囊肿的主要症状表现为月经失调，小腹疼痛，腹胀，腰酸，白带增多，不孕症等，囊肿大多是良性的。囊肿比较小的，对机体的各方面影响不大，不会影响生育。平时要做到随访观察，定期复查。
卵巢囊肿是妇科病，需要妇科检查及超声检查看卵巢大小来决定是否手术。可以挂妇科、生殖科。如果卵巢囊肿肿块持续存在或增大，或有实质性改变，或伴有肿瘤标志物异常升高等，则卵巢肿瘤的可能性较大，应进一步检查治疗，必要时手术治疗。
