精子畸形率高多的是由肾功能缺陷，精索疾病，睾丸的功能障碍，如饮酒过量，长期手淫、体质较差、营养不良、休息不好等都有可能造成障碍；另外，有的与炎症有关系，如睾丸炎等。
精子畸形不会导致胎儿畸形，胎儿畸形与精子畸形不是一回事。精子畸形只是形状不正常，影响受精能力，精子内在质量才是影响胚胎质量和流产的主要因素。单纯精子畸形率高不会导致流产率和胎儿畸形率升高，但是部分畸形精子症患者存在精子DNA碎片率高、染色体异常等疾病，才会造成流产率和胎儿畸形率升高。
如果精子畸形率很高，及时到医院治疗，不要担心太多，可以使用一些神经药物来改善。同时，患者必须采取更多的户外活动，提高免疫力，戒烟，吃黑豆，黑芝麻，黑米，黑木耳，牛肉，羊肉，加强身体，性生活不应太频繁。
精子畸形会一般会引发不孕不育。精子畸形一般表现为出现性功能障碍，引起全身不适：出现倦怠乏力、纳食不香、腹胀闷等，时而出现腰膝酸软等症，或伴有精索静脉曲张可有睾丸坠胀表现等。
畸形精子形态指数和精子畸形指数是没有区别的。精子畸形是会影响到患者受孕的。畸形精子过高会引起不孕或是受孕后发生流产胎停育等，引起畸形精子症的原因有泌尿生殖道感染、腮腺炎并发的睾丸炎、附睾结核、精索静脉曲张等，均可导致畸形精子增加。
精子畸形如果没有什么器质性病变，可以平时生活习惯加以改善，注意不要骑自行车之类的了，要穿有一定弹性吸汗的内裤，宽松的外裤。尽量多走路，多锻炼身体，可以买番茄红素和维E来吃，不要吸烟喝酒。在畸形率偏低的时候再试孕也是可能成功怀孕的。