通常情况下，怀孕40天的患者能做流产。具体情况分析如下：
怀孕40天的患者如果做药物流产药物流产，一般是指在停经49天之内，患者可以按照医嘱使用米非司酮片、米索前列醇片等药物进行流产，先使体内的孕酮活力下降，进而引起流产，再通过药物使子宫剧烈收缩，将妊娠组织排出体外的一种流产方式，因此怀孕40天的患者能做流产。
流产后当月在无有效避孕方法的情况下，有性生活是可能再次怀孕的。
流产后的恢复排卵周期一般在8-103天左右。一般是二十一至二十九日。所以，在流产后当月如果没有避孕措施，就会有再怀孕的危险。在流产后2个星期之内不要同房，以免引起炎症。建议按照生育需求来进行适当的节育。比如在做完人工流产手术之后可以通过服用一些短期避孕药物、放置宫内节育器、使用安全套等方式来避孕。
怀孕40天进行流产后是否需要清宫要根据流产后复查结果判断。
怀孕40天进行药物流产或人工流产都可以，两者没有本质区别，安全性较高，残留率较低。通常流产后大概两周要复查B超，看宫腔内有无残留。
第一，若有体积小于3cm以下的实性残留或少量液性暗区，血流不丰富的情况，可口服药物促进宫缩，或等来月经，通过月经大部分都可排出体外。
第二，若宫腔内残留无法通过上述方法排出，或残留的体积较大，血流丰富的情况下就需要进行清宫。
流产后血血妊娠40天后如果发现有孕囊，就可以进行人工流产。妊娠40天可以选择药物流产和人工流产，两者都有优缺点。
如果药物流产成功，不需要做清宫，对子宫的伤害也不大。不过，药物流产的成功率很低，大约在60%到70%之间，如果药物流产失败，就需要进行清宫。人工流产的成功率很高，但是如果用手去抓取子宫，或者用手去抓取，就会对子宫造成伤害。
怀孕见红了不一定会流产，怀孕见红又称早孕红色，是妊娠12周内少量阴道血液分泌，类似于月经初期或晚期出血量，有很多孕妇会因为见红导致流产。妊娠早期出血与宫颈病变，异位妊娠，葡萄胎等因素也有关。
妊娠40天内发生流产的原因有以下几点：
1.妊娠40天是胎儿刚刚着床，在此期间，如果出现剧烈运动、过度劳累、精神压力大、同房等因素，都有可能导致流产。
2.怀孕40天后，胎儿发育不全，很有可能会导致流产。
3.如果女性在孕期压力过大，或者是心情低落，那么就会出现妊娠40天的流产。
4.怀孕初期，如果不注意饮食，或暴露于有毒物质，怀孕40天后可能会出现流产。