肛瘘反复发作，肛门分泌物可引发肛门湿疹导致瘙痒，影响生活、工作。肛瘘炎症反复刺激，部分人可出现发热、感染等症状。肛瘘出现感染、发热症状，须尽快就医，查看肛瘘是否局部形成脓肿，如果有脓肿形成，需手术切开引流。
肛瘘又称肛门直肠瘘，主要症状包括局部的流脓，往往在肛周特定部位会反复流脓及出现局部肿胀，还可自行触摸到有很明显的条索感，常伴有排便困难、贫血、身体消瘦、精神萎靡、神经衰弱等。
肛瘘的检查方法可以做肛门指检，肛门指检为最常见、最直接的检查方法，可触及条索状物及硬结。还有就是美兰造影，将美兰从外口打进，如果美兰由肛门流出，可诊断肛瘘。影像学检查包括B超、磁共振、肛瘘造影。手术探查需在麻醉状态下进行。
肛门经常有少量大便排出的症状应考虑肛瘘的可能。肛瘘是常见的肛门疾病。肛瘘主要侵犯肛管，其外口流出少量脓性、血性、粘液性分泌物为主要症状。较大的高位肛瘘，因瘘管位于括约肌外，不受括约肌控制，常会有粪便及气体排出。建议到当地正规的医院检查治疗，注意保持好局部卫生，避免过紧内裤摩擦，按时坐浴和涂药，尽量不吃辛辣和肉类食品，以免便秘后加重病情。多喝菜汤，多吃水果，有助于患处康复。
肛门口周围流脓周期性发作，时有时无，脓液较少。肛门口周围肿痛一般不疼，当脓液积存于管腔内引流不畅时，局部胀痛，当脓液流出后疼痛马上减轻。肛门口周围有肿块，大部分可在肛缘触及索条状硬块，按压轻度疼痛。