年轻，有生育要求者一般选用保守性手术，只切除病灶，保留子宫及附件(尽量保留双侧)。对于一些无生育要求，病灶严重，且年龄在45岁以下的女性朋友，可以选择半治疗手术，尽可能保留一侧正常的卵巢组织，而全切子宫和病灶，术后复发率低，后遗症少。
子宫内膜异位症如果不及时治疗，很容易由于盆腔内存在病灶，使输卵管周围发生粘连或者是阻塞，阻碍了精子和卵子的结合，从而导致不孕造成女性不孕。子内膜异位症的病人还有可能会排卵障碍，没有破裂卵泡黄素化和黄体功能不足，这些都是造成不孕的。
子宫内膜异位症之所以发生不孕，是由于异位的子宫内膜发生周期性出血，血液不能外流，刺激盆腔腹膜，发生粘连，形成疤痕，使输卵管受压梗阻；或使输卵管浆膜粘连成束、扭曲，从而影响摄取卵子的作用。
子宫内膜异位症是一种常见的妇科疾病，定义为子宫内膜组织生长在子宫腔以外引起的病症，所以不会是不孕症。如生长在子宫肌层、卵巢或盆腔内其他部位，约有50%左右内异症伴有不孕症，其常因病变造成盆腔肿块粘连、输卵管堵塞或者是卵泡发育不好或排卵障碍等因素引起。其主要的临床表现为痛经、月经不调、性交疼痛。
最初认为诊断是子宫内膜异位症。子宫内膜异位症导致不孕是由于月经失调，会导致卵巢出现排卵的障碍，再者可能是输卵管堵塞的问题引起的，出现病情要及时的对症治疗，积极配合医院的治疗，不要拖，孕前要做好身体检查。
子宫内膜异位症要抓住早期治疗，控制子宫内膜异位症发展，防治疗后复发。子宫内膜异位症的治疗方法很多，有手术治疗，西药及中药治疗。西药治疗子宫内膜异位症：多为以假孕疗法为基础。中医中药治疗子宫内膜异位症：具有缓解疼痛、调经助孕、改善症状等显着疗效，同时通过对内分泌、血液流变学、生殖、前列腺素合成于代谢及免疫等方面进行调节，改善生殖系统的功能，以达到提高受孕率的目的。