最常见的原因睡前宝宝兴奋引起的生物功能行为异常，夜啼、夜惊等；其次就是微量元素或维生素缺乏引起的夜间哭闹，食欲不振，偏食挑食等；再就是肠道寄生虫病，特别是蛲虫引起肛门周围有蠕动感，宝宝不舒服会哭闹。
一般情况下，两岁宝宝半夜发烧39度，可以通过药物治疗、物理治疗、日常护理等方法进行治疗。具体分析如下：
1.药物治疗：两岁宝宝半夜发烧39度，属于高热的范畴，家长可以在医生的指导下使用布洛芬混悬液、对乙酰氨基酚混悬滴剂、小儿豉翘清热颗粒等药物给宝宝治疗。
2.物理治疗：两岁宝宝半夜发烧39度，可以贴退热贴、用冰块冷敷额头、温水擦浴、等，达到物理降温的效果。
3.日常护理：平时多带孩子进行体育锻炼，具有增强体质的效果，还要多晒太阳。
宝宝总是半夜总哭闹可能是缺钙和胃肠道不适，有胀气。
建议给宝宝检查微量元素及是否缺乏维生素D，若是钙质和维生素D缺乏要及时补充，可以服用钙剂或吃些钙质和维生素D丰富的食物，如牛奶，可以适当日光照射。有明显胃肠道不适，如舌苔厚、大便酸臭，要给宝宝用四磨汤调理，缓解胃胀气和胃肠道消化吸收，哭闹的症状会缓解。
2岁的孩子在半夜哭，有可能是因为孩子做了恶梦，如果孩子在白天看了动画片等电影，有些电影会刺激到孩子，引起孩子做噩梦，从而引起孩子的哭闹。也有可能是因为孩子在白天跌倒或者是撞到了什么东西。如果孩子犯了错误，被家长训斥，或者是父母说了一些不合适的话，这些都会导致孩子精神上的压力，从而导致晚上哭。平时给孩子少吃辛辣刺激的食物保持充足的睡眠，少熬夜。
两岁的宝宝半夜老是喝水，首先看是不是房间空气太干燥，或者食物太咸，要改变家庭的饮食习惯。毕竟晚上起来喝水，孩子醒来以后会持续一段时间睡不着觉，即使能很快的入睡，可能对孩子的睡眠质量也会有一定的影响。如果气候干燥以及体质热的情况，也会出现夜间喜欢喝水。建议做好防护，维持房间的湿度和温度，注意饮食调整，以容易消化的食物为主，适当的多吃新鲜蔬菜、水果。
两岁宝宝半夜突然大哭通常是噩梦、饥饿、排便、感冒、肠胃不适等因素导致的，具体情况分析如下：
1、两岁宝宝如果夜间经常会做噩梦，也就是俗称的梦魇，可能会导致突然大哭；第二，宝宝晚上会突然饥饿，想要食物，所以才会哭。第三，也可能是因为宝宝突然排便，身体不舒服，进而导致哭泣；第四，也可能是因为宝宝感冒后发热，进而在不舒服的时候突然大哭；第五，儿童若有肠胃方面的问题，比如呕吐、拉肚子、胃肠积气，夜间会有肠绞痛、痛哭等症状。
