巧克力囊肿可采用中医中药调理治疗，具有清热去湿，活血化瘀，养血补气的功效。腹腔镜手术治疗，应为内异症的首选治疗方法。症状及病变均严重的无生育要求的可行此手术。也可以吃一些西药。
急腹症的表现是腹痛、厌食、恶心、呕吐、腹泻或便秘、发热等。急腹症是指腹腔内、盆腔、腹膜后组织和脏器发生了急剧的病理变化，从而产生以腹部为主要症状和体征，同时伴有全身反应的综合征。
不可以吃巧克力的。因为巧克力本身并不是单纯的糖分，其中还有含有很多的油脂，同时糖尿病需要随身携带一些糖块儿预防低血糖，但由于巧克力中含有的单糖数量非常少，同样起不到纠正低血糖的效果，所以不适合吃。
卵巢子宫内膜异位囊肿又名巧克力囊肿，也是较为常见的卵巢囊肿，是由于子宫内膜异位症波及卵巢在卵巢内形成含有巧克力样粘稠液体的囊肿，明显的症状就是痛经，而且进行性加重的，不孕以及月经失调。可以去医院做手术治疗。
克力囊肿引起管腔闭塞、囊肿或粘连，均会妨碍精子、卵子或受精卵的运行，致使受精卵到达宫腔产生障碍而发生宫外孕。宫外孕时引起的输卵管破裂大出血，可危及生命。巧克力囊肿生长到一定阶段，就会引起输卵管粘连、堵塞，破坏输卵管的正常生理功能，从而导致继发不孕症。适当多吃一些优质蛋白质、B族维生素、叶酸、铁、钙等营养物质，如鸡蛋、猪肝、牛奶、豆类及其制品、新鲜蔬菜、蘑菇、木耳、海带、紫菜、鱼类等。
巧克力囊肿是由于子宫内膜异位症引起的。子宫内膜异位症是指子宫内膜组织出现在子宫体以外的部位。其发病原因可能是经血逆流。有的子宫内膜异位症，没有任何症状，但大多都会表现为下腹痛和痛经，不孕，性生活不适，月经异常和子宫内膜异位囊肿，子宫内膜异位囊肿就是卵巢巧克力囊肿。