一般来说，儿童过敏性结膜炎用抗炎抗过敏药。
过敏性结膜炎又称为变态反应性结膜炎，是结膜对外界变应原产生的一种超敏反应。可以使用抗炎抗过敏药物糖皮质激素如泼尼松眼药水、H受体阻滞剂如奥洛他定眼药水等来治疗，也可以吃扑尔敏来治疗。家长需要带孩子到眼科检查原因，然后对因对症治疗。家长要适当调整小儿的饮食结构，尽量以清淡为主。
儿童有过敏性结膜炎要注意卫生。如果睛部有粘稠脓汁，要用棉花擦拭干净。注意家居卫生，要常打扫居室，减少灰尘，不要接触室外的过敏原，像花草、花粉、灰尘、霉菌和动物等。
首先可以通过药物进行治疗，另外发现睛部有粘稠脓汁时，注意要及时用棉花擦拭干净。平时注意家居卫生，要常打扫居室，减少灰尘，在这期间尽量让孩子外出，以减少接触室外的一些过敏原。
过敏性结膜炎可以在短时间的几个月内治愈；如果是长期的，可能需要数年的时间。具体的治疗时间要视情况而定，大部分都能在短时间内恢复。
春季过敏性结膜炎在反复发作后，会持续数年。小儿过敏性结膜炎可以用药物进行抗过敏治疗，但药物抗敏治疗仅能抑制过敏症状，预防和维护是非常关键的。在花粉最多的时候尽量不要出门，最好是带上护目镜。大部分的孩子都不能确定过敏源，所以孩子的过敏性结膜炎复发很难根治。
儿童过敏性结膜炎症状轻微，一般会自行恢复。
但如果局部症状比较明显，如眼睛瘙痒严重，眼睛不停的眨眼，且不能自控，需要尽早进行干预，避免对眼睛造成损害。过敏性结膜炎发作后，患儿眼部会出现异常瘙痒的症状，从而导致注意力不集中，影响学习。过敏性结膜炎一般不会影响儿童的视力，但如果患儿出现了春季角结膜炎、特应性结膜炎等情况，可能会导致角膜并发症，从而影响孩子的视力。过敏性结膜炎可根据患儿的症状进行局部冷敷或在医生指导下局部应用抗组胺的药物，一般3-4周左右即可得到缓解或恢复。
一般情况下，小儿患有过敏性鼻炎、结膜炎等疾病时，可以在眼睛内滴敷妥布霉素滴眼液，缓解瘙痒、流眼泪、眼睛充血等现象，过敏性鼻炎可以使用糠酸莫米松鼻抗剂，3岁以后即可使用。服用盐酸左西替利嗪滴剂、氯雷定分散片、孟鲁司特钠咀嚼片等具有良好的抗过敏作用，服用一星期后即可明显好转。在这个过程中，可以多吃一些水果，可以增加人体对身体的免疫力，降低病情的发展，同时可以服用一些匹多莫德冲剂来提高免疫力。