系统性红斑狼疮患者小剂量的激素长期使用，对于控制非常稳定且脏器损害不多的可考虑停用激素。治疗用药一般使用非甾类药物、激素、免疫抑制剂、生物制剂等。因系统性红斑狼疮免疫炎性反应明显，所以一般都使用激素治疗，且活动期的时候使用剂量较大，待病情控制稳定后逐渐减量。
系统性红斑狼疮积极配合治疗，通常是可以治疗恢复的，红斑狼疮疾病本身属于结缔组织病，在结缔组织病里也是很严重的疾病。对于红斑狼疮的治疗，要从两种方面来进行分析，首先要了解症状。
抽血检查，如血常规、生化全项、尿常规、抗核抗体、抗Sm抗体、抗双链DNA抗体、免疫球蛋白测定、补体测定、抗心磷脂抗体等。由于系统性红斑狼疮可会造成肾脏的损害，所以需要查肾脏彩超、24小时尿生化三项，必要时需要做肾脏穿刺活检。由于会造成心脏、肺的损害，所以还需要查心脏彩超以及肺CT等。
第一避免诱因，如：避免日晒、避免吸烟。第二饮食，SLE患者应给予平衡、健康、营养的膳食。第三休息与锻炼，在缓解期可进行适合于自己的循序渐进的身体锻炼。第四皮肤护理指导，第五用药护理指导。
系统性红斑狼疮的治疗方法有，非药物治疗主要保持乐观积极的情绪、保持充足的睡眠、避免劳累、避免反复感冒、避免长时间紫外线照射、少接触化学制品，女性的尽量少烫发、染发，尽量用温和的护肤品。
系统性红斑狼疮预期生存时间存在个体差异，不同的发病机制和临床表现不完全一致。在病情稳定和积极科学治疗的基础上，大多数5年生存率可达90%以上，10年生存率达85%以上。然而，如果在疾病的早期出现严重的器官受累，如肾功能不全、神经病变等危险因素，预后相对较差，甚至过早死亡。