导致阴茎肉芽的原因是包皮炎、龟头炎等生殖器感染性疾病，主要是因为发生不洁的性生活而受到感染；包皮垢和细菌刺激龟头导致；不注意个人卫生，导致交叉感染或是病菌直接感染。
是因为不注意个人或者是性生活的卫生引起的，需要注意经常清洗的损害大小及形状不等，可仅为数个，亦可为多数针头样大的损害。在阴肛部可长成大的肿瘤样物，有压迫感；有恶臭味；有时小的湿疣可出现阴部痛痒不适，病人可出现尿血和排尿困难；直肠内尖锐湿疣可发生疼痛、便血，而直肠内大的湿疣则可引起里急后重感。
大阴唇上长了几个肉芽有可能是由于慢性炎症，或者是由于病毒感染引起的情况，病毒感染引起的尖锐湿疣就是局部呈肉芽状的，可以去医院做一个妇科检查，及时采取外用药物进行治疗。
这是尖锐湿疣的可能性大，尖锐湿疣初起为细小淡红色丘疹，后逐渐增大，表面凹凸不平，湿润柔软，呈乳头样、蕈样或菜花样隆起，红色或污灰色，根部常有蒂，且常易发生糜烂、渗液，触之较易出血。这些都是尖锐湿疣的临床表现。
避免进食辛辣刺激食物，远离烟酒，考虑主要属于炎症感染引起的精囊炎，或者是尖锐湿疣都是有关系的，要及时的用药治疗观察，以免延误病情。这段时间要禁止性生活，应该到医院用激光全部清扫。
首先考虑是尖锐湿疣。有不洁的性生活，龟头边又长了小些肉芽，这些小肉芽常常伴有瘙痒的症状，早期有自行脱落的情况。小肉芽大小不一，表面不光滑，有小的凸起，像菜花状，可以做一个醋蛋白试验。如果醋蛋白试验阳性，可以确诊是尖锐湿疣。也可以取小肉芽送病理科，找到挖空细胞，也可以确诊小肉芽的情况。如果出现米粒大小的小肿物，不能排除是湿疹。
