肥厚梗阻型心肌病的处理方法有心脏超声检查、不要做增加心脏负荷的剧烈活动、心脏切除手术等。
就诊时最好是让亲属做一次心脏超声检查，看看是否有遗传性。在处理方面，不要做任何会增加心脏负荷的剧烈活动，比如用力大小便、快跑等；其次是药物治疗，可以口服地尔硫卓和美托洛尔减缓疾病的发展；如果有必要的话，还可以进行心脏切除手术。
肥厚性心肌病需根据具体病症进行治疗。
肥厚型心肌病一时之梗阻性肥厚型心肌疾病，针对该病的治疗，可以选择药物保守治疗，常用的药物有纠正心衰的药物、逆转心室重构的药物，例如β受体阻滞剂等。梗阻型肥厚性心肌疾病比较危险。因为梗阻往往会出现低血压、恶性心律失常、心绞痛等症状。如果心排血量受阻，会导致机体供血不足，脑供血不足，冠状动脉供血不足，这是非常危险的。一般都会选择无水酒精消融，这样可以减轻梗阻，从根本上治疗。
肥厚性心肌病是不能完全治愈的，只能维持患者病情稳定，延缓患者心脏功能减退的进程。
肥厚性心肌病是目前引发我国青少年运动性猝死的主要原因，因此在日常生活中，诊断为肥厚性心肌病的患者应避免剧烈运动，以免剧烈运动时，心脏供血不足，引发脑供血不足，全身循环血量不足，恶性心率失常等。但是如果可以找到合适的心脏供体，行心脏移植术，本病即可治愈。但综合各方面条件，如心脏移植供体来源稀缺，移植排斥反应，体外循环感染等情况，导致其风险较大。肥厚性心肌病主要是与遗传有关。
肥厚型心肌病属于一种心脏构造不正常的病变，如果有肥大的梗阻性心肌病或者肥大的非阻塞性心肌病。
肥厚型心肌病常会出现流道梗阻，出现胸痛、胸闷等情况，甚至是突发事件。而肥大的非阻塞性心肌病一般不会发生阻塞，但随着病情的恶化，也有可能会引起一些较为严重的临床表现，所以要对症治疗。肥厚型梗阻性心肌病应及早进行手术，如采用室间化学消融或外科手术等，但通常都是无效的。如果是肥大的、无梗阻的心肌病，可以口服ACEI类的药物来控制其心肌重塑，同时还要定时进行心脏超声波检查。
一般情况下，肥厚型非梗阻性心肌病可能与基因有关，其病理学特征是：
一侧或两侧的室间室厚度增大，室间厚度比左侧后壁大，并伴有或不伴有左室出口狭窄。临床上需要做的是心脏彩色超声检查。临床上常见的症状有胸闷、胸痛、心慌、疲倦、活动能力降低等，有些病人在激烈的锻炼过程中出现突然死亡。肥胖型梗阻心肌病患者要保持良好的作息习惯，平时要多做一些锻炼，少做一些剧烈的活动，不要过于兴奋。可以使用美托洛尔、索洛尔、地尔硫卓、伊纳普利、培哚普利等能明显减轻心脏的收缩能力、减缓心跳、抑制心脏重塑。心脏介入性射频消融，心脏手术切除大面积的心脏。
肥厚心肌病患者可以通过消融手术进行治疗，还可以选择药物治疗控制疾病进展，肥厚性心肌病病人可选用扩张血管药品，还可使用降压药品或利尿药品缓解，单纯靠中药疗效不甚理想。
平时多加注意身体护理，定期去医院通过心电图检测进行判断。肥厚型心肌病病人选用β受体阻滞剂，可有效避免心脏部位收缩减弱，对肥厚性心肌病疗效均有效。
对于已经确诊为肥厚性心肌病者，需要积极地配合中医和西医治疗，同时在日常饮食方面注意清淡，避免肥甘厚味。肥厚性心肌病病人应定期体检，可选用药物治疗，控制疾病进展，可选用中药，改善血液循环，还可选用中西医结合的方法。