自身免疫性的损伤引起，常见的有桥本甲状腺炎、产后甲状腺炎、萎缩性甲状腺炎等。甲状腺腺体本身破坏，例如进行甲状腺的手术，或放射性碘131治疗破坏部分甲状腺。过量使用碘，造成具有潜在性的甲状腺损害进一步加重。药物作用，尤其在治疗甲亢的过程中，运用了抗甲状腺药物，在减药的过程中，如果没有进行及时减药，可能会出现暂时性药物性甲减。
甲低的主要症状是疲劳，感觉迟钝，动作缓慢，智力减退，记忆力严重下降，嗜睡，注意力不集中，发凉，怕冷，毛发干枯脱落，男性胡须生长慢，无汗及体温低于正常。还有自然衰老的表现，皮肤干燥增厚、粗糙并多脱屑、脱发等。
甲低即甲状腺功能减退，婴儿的症状比较典型，危害较大，具体如下：
甲状腺素严重缺乏，可能有典型的甲低面容，如面部臃肿、表情淡漠、舌外伸、唇厚舌大、眼睑下垂、毛发稀疏、反应迟钝等，还有智力低下、记忆力和注意力降低、行走延迟、运动发育落后、语言听力等发育落后，还可能表现为生长发育停滞、身材矮小，手短但躯干较长、心脏扩大、心音低钝，顽固性便秘等。
甲低也称甲减，是指甲状腺功能减退的疾病。这一类疾病一般应以药物治疗为主，有很好的疗效。由于甲减病情和缺碘有关，所以可以适当的吃一些含碘的食物，比如海带、紫菜等。另外甲减的患者代谢功能较差，营养较差，可以适当的补充蛋白质，如鸡蛋、牛奶、肉类、鱼等。植物蛋白也可以补充，如蛋白质、豆制品等。甲减的患者会出现贫血，一些动物的肝脏可以食用，同时要注意多吃蔬菜水果等丰富营养。
甲状腺功能减退症，可能会出现漏诊，常常是在体检当中，无意发现甲状腺功能减退症。比较典型的甲低症状，可以表现为乏力、怕冷、体力不支、手足肿胀，还有记忆力减退，或者嗜睡的情况。