一般来说，小脑扁桃体疝可通过药物、日常调理等方式进行治疗，具体如下：
通常情况下，小脑扁桃体疝是由于颅内压增高导致的，通常需要及时进行手术治疗，以免患者病情加重，造成严重后果。
在治疗期间，患者应当注意健康饮食，多吃新鲜的蔬菜和水果，少吃生冷、辛辣、油腻、刺激的食物，戒烟戒酒，注意休息，定期到医院复查。
一般情况下，小脑扁桃体疝是不能自行愈合的。具体分析如下：
小脑扁桃体疝气是一种先天性的后颅窝先天畸形，是一种不可治愈的先天性病症。因为生长不足，后颅腔体积缩小，对小脑的支持不足，引起小脑的偏下，小脑的扁桃体向下移动，会压迫大脑，或者突进脊柱，从而引起四脑室的压力，引起脑脊液的流通受阻，从而引起脊髓中心管的扩大，从而产生脊髓的孔隙，从而产生感官分离的体征，严重者会引起四肢的运动受到限制，局部的肌肉萎缩，甚至是严重的烧伤才发现。
一般情况下，小脑扁桃体疝不做手术，需要保护颈椎，避免运动。具体分析如下：
小脑扁桃体疝分为急、慢性两种，如果是急性的，可能会危及到患者的性命，需要立即进行外科治疗，这样才有可能保住性命。而慢性小脑扁桃体斜疝则是因为先天性原因，导致了颅颈部位的异常，导致小脑扁桃体突出到了枕骨大孔之下。这个要看患者的表现和MRI的表现，如果不做，那么在平时生活和工作中要注意保护颈椎，不要过于运动，否则会出现很大的风险。
小脑扁桃体疝出现后病患的不良表现比较多，早期病患发病后往往会出现面部麻木、复视、耳鸣、听力障碍、发音异常，也有病患会出现延髓、上颈脊髓受压症状，或者是一侧或四肢运动同感觉有不同程度的障碍。发现之后要做的是对正观察，合理调节治疗。
小脑扁桃体下疝合并脊髓空洞症，相对来说是比较常见的一种复杂颅底畸形，多见于脊柱神经外科。主要是通过手术医治。手术方式包括后颅窝减压手术、硬脑膜扩大减张缝合手术，必要的时候还要做脑积水以及脊髓空洞症的内引流手术。
一般来说，小脑扁桃体下疝脊髓空洞症手术过程较为，具体如下：
通常情况下，小脑扁桃体下疝脊髓空洞症手术是全麻手术，患者一般需左侧卧位，用磨钻咬除右侧后颅窝骨质，咬开枕大孔后缘及寰枢椎后弓，进行引流，最后进行缝合。
在手术后，患者应注意卧床休息，避免剧烈运动，保持愉悦的心情，以清淡、易消化的饮食为主，注意营养均衡。