输尿管结石治疗方法要据病人的具体情况而决定。若结石体积较小、存在时间的短，输尿管及膀胱无梗阻、采取保守治疗便可将结石排出，如药物治疗、多饮水及适当运动等。而需手术治疗输尿管结石的适应症如下：输尿管、尿道或膀胱存在畸形或狭窄，即便结石体积小也需要手术治疗。
及时的去医院做个肾脏彩超或者是尿路造影，有堵塞需要及时碎石或者手术取石治疗。输尿管结石肾积水，影响了新陈代谢，输尿管结石肾积水的治疗要根据结石大小、部位、数目、形状、一侧或两侧、有无尿流梗阻、伴有感染、肾功能受损程度。
尿管结石伴有肾积水，提示已出现梗阻性肾病，建议积极排石治疗，尽早解除梗阻。根据结石的大小，可以采取内科治疗和外科治疗。如果结石直径小于0.6cm，一般通过应用解痉的药物，比如654-2，钙离子拮抗剂，多饮水，多运动可以排除体外。如果结石超过0.8cm，就要采取外科治疗，比如体外震波碎石，或者是输尿管镜，或者是开放手术治疗。
输尿管结石的手术方式包括体外震波碎石、输尿管镜弹道碎石等，常见的手术后遗症有输尿管狭窄，手术操作过程中或碎石过程中，对黏膜会产生一定损伤，甚至导致疤痕形成，引起输尿管狭窄，血尿，术中操作损伤可引起出血，导致血尿的发生，残留结石，术中需用水保持视野清楚，在外力作用下易将结石冲到肾盂和集合系统内。
肾积水伴输尿管结石可以通过一般治疗、药物治疗、手术治疗来改善病情。
1、一般治疗：当出现肾积水合并输尿管结石时，患者可能会出现恶心呕吐、腰腹部疼痛、排尿困难、血尿等不适，在治疗的过程中要注意多喝水，适当的运动，一般有利于缓解梗阻的情况。
2、药物治疗：建议遵医嘱进行药物治疗，如使用枸橼酸氢钾钠颗粒、碳酸氢钠片等药物，可以碱化尿液，促进结石排出。如果出现了肾绞痛，一般要遵医嘱应用双氯芬酸钠缓释胶囊等非甾体类镇痛抗炎药物。
3、手术治疗：在保守治疗无效的情况下，可积极就医，采用体外冲击波碎石、经皮肾镜碎石术、输尿管镜碎石等方法进行治疗。
输尿管镜取石术发生并发症，穿破输尿管或者造成狭窄。结石直径超过1厘米或者是表面粗糙呈多角形正。结石嵌顿过久输尿管发生严重的梗阻及上尿路感染。需要开放手术取石。