手掌上起小水泡脱皮的原因主要有以下几种：
1.掌跖脓疱病：本病的发病原因具体原因不明，会有成群分布的小水疱脱皮、结痂。可以服用复方甘草酸苷胶囊，如果有瘙痒症状，可以服用盐酸左西替利嗪胶囊，还可以外用强效糖皮质激素软膏，比如卤米松软膏。
2.脱皮角质松解症：主要是由于接触水泥、沙土等引起的皮肤疾病，是一种常见的脱皮角质松解症。可以外用地奈德软膏等弱效的糖皮质激素软膏，也可以口服氯雷他定糖浆，用于治疗瘙痒。
可能是汗疱疹，表现为掌跖、指趾侧面的水泡性损害，半球形因稍高出皮面，疱液清亮，干涸后形成领口状脱屑现象，有痒感。这样可以外用抗菌类药物涂抹患处，严重配合消炎药进行治疗。平时避免酒类及辛辣食品，接触洗衣粉、洗洁精的时候用手套。
如果手上有小水泡，同时伴有瘙痒的情况下，目前要谨防孩子出现手足口病的可能性，要多注意观察，应观察一下孩子的口腔有没有出现疱疹，如果洗澡的时候发现，那么就是因为一些洗剂，比如碱性的洗剂，还有就是因为温水热水泡了以后引起的，所以说平时尽量减少接触，洗澡的时候不要再加这些清洗剂。
真菌感染引起手上起水泡，诊断是手癣，手癣的治疗，主要是抗真菌治疗，可以应用外用药物，外用药物可以选择软膏等。部分人对该药耐药，效果可能不好。平时如果有脚气，洗袜子的时候，尽可能戴手套，因为真菌感染会自体传染，不戴手套有可能会把真菌菌丝带到手部，导致手癣的发生。
有可能是真菌感染导致的手癣。临床表现为单侧手背部或手指周围的皮肤出现散在的，无色的水泡，伴有瘙痒。手出汗或遇热之后，瘙痒加剧，部分水泡可以破溃，有液体渗出，水疱干涸结痂后，表面会有轻度到中度的脱屑。
可能是真菌感染或者是疱疹病毒感染所致，需要及时的进行治疗，当然也有可能是存在真菌感染的情况，也可以引起这种表现，这两方面的一些因素都可以引起目前的水泡后发痒的出现。