细菌性痢疾是由于细菌导致的，所以应该选择敏感性的抗生素来治疗。可以经验性使用药物，同时进行药敏实验，及时调整药物治疗。同时应注意避免服用止泻的药物以免加重病情。可是适当给予盐水来改善失水的情况，保持水电解质的平衡。
首先在治疗上需要抗感染治疗，如果腹泻较频繁者，还需要通过静脉输液来补充电解质，同时在饮食上要清淡易消化为主。一般在治疗后5到7日即可康复。忌肉类浓汁及动物内脏，忌粗纤维、胀气食物，忌性寒滑肠食物。
通常情况下，婴儿细菌性痢疾腹泻可以通过药物来治疗。具体情况分析如下：
婴儿细菌性痢疾腹泻的治疗，首先是应用抗菌素，细菌性痢疾是感染了痢疾杆菌造成的，此时就要应用头孢克肟等头孢菌素进行抗细菌治疗，等肠道的细菌被杀灭以后，孩子的腹泻症状自然就会好转。其次是给予对症支持治疗，如果腹泻的量比较多，要给予口服补液盐以纠正脱水和电解质的紊乱；发热超过腋下38.5度时，要给予布洛芬退热。
应采用中医治疗，按中医分型辨证施治用汤药治疗，同时可加用针刺治疗以调整肠道功能紊乱。抗菌治疗，在治疗上一定要保持水电解质酸碱的平衡，对脱水者来说，一般应该口服补液严重者需要输液来进行均衡身体。
细菌性痢疾会传染。细菌性痢疾指的是由痢疾杆菌感染所造成的急性肠道传染性的疾病。急慢性的痢疾患者以及带菌者为本病的传染源，主要通过粪口途径进行传播，人群普遍易感，感染以后可以获得一定的免疫力。