如果局部没有疼痛、局部没有明显突起，肿物生长缓慢，只需定期行X线检查，动态观察，不需要做特殊处理。如果肿瘤部位活动时疼痛，或者局部短时间内生长迅速，就需要手术切除。
儿童软骨瘤是可以观察的，但是如果影响宫内或者是生长迅速的情况下，需要进行手术治疗的。小儿的骨骺没有闭合，手术是会影响发育。良性的只要手术切除完全就可以了，一般是可以治愈的。
对于软骨瘤通常采用手术治疗。对于内生软骨瘤，可以采用病灶刮除植骨术；多发性内生软骨瘤因恶变的机会较大，一旦发生恶变就要进行截肢手术。对于因为关节磨损而出现的骨碎屑，或者伴有疼痛，可以采用理疗治疗.因为骨软骨瘤是一种良性的肿瘤，所以良性肿瘤治疗大部分就是手术切除。
多发骨软骨瘤是否需要手术治疗，需根据具体病况来决定。例如为低龄患者，且骨软骨瘤发生在骨骺附近，此时就不建议手术治疗，以避免影响病变骨头发育，而造成严重后果。如果是青春期的患者没有出现疾病症状的，也可不做手术治疗。但若是疾病影响至周围关节运动的，待骨头发育成熟后再行手术治疗，以避免复发及对关节正常发育造成影响。
如果囊肿比较小，还有就是单发，一般问题不大的，但是如果比较大，然后这个可以压迫肾组织，然后引起这种肾皮质髓质缺血导致血肌酐升高等。观察就可，不必做太多处理，肾囊肿只有在体积很大引起临床症状和影响肾功能时才需要处理。
肾萎缩，那么应该可能是慢性的炎症引起的，可考虑中西结合治疗，中药以补肾为主，西药帮助消炎。二个方面同时治疗可能效果会更好，同时定时间做相应的检查，中药用药请有经验的中医内科老的医生开方，西药配合消炎可能会更好。