中央型肺癌可以通过支气管镜确诊，周围型肺癌需要通过超声支气管镜，如附有电磁导航的支气管镜取活检进行病理诊断。通过支气管镜还能检查的疾病包括肺部感染患者、支气管内膜结核患者、异物误吸患者、气管狭窄患者等。
任何侵入性的检查都是有风险的，但有时为了明确诊断，进行侵入性的检查是有必要的，支气管镜好处在于它可以活检，取一点气管的细胞出来，在显微镜下看到底有什么病，这样就可以确诊，所以危害不大的。
气管镜检查癌症准确，目前所有的癌症的确诊主要是通过病理细胞学检查来确诊的。如果有相应的症状，例如咳嗽，咳痰等肺部症状，可以做肺部CT。肺部CT可能高度倾向于肺部癌症，但是确诊还是依赖于病理细胞学。
做任何要侵入的检查都是有一定风险的，因为把支气管镜伸入到体内，是具有一定的危险的。但是支气管镜也还可以做活体检查，所以他的风险相对又会小一些。可以将支气管镜提取的活体细胞，放在显微镜下面观察，就可以检测取得细胞的部位有没有发生病变。
气管镜检查需要八分钟到20分钟左右，气管镜检查是将比较细长的一根管子，从病人的嘴里或者鼻腔进入气管和支气管以及更远端，直接观察气管和支气管的病变，甚至可以根据病变进行相应的检查和现场治疗。
在进行支气管镜检查的过程之中，病人会经常会出现刺激性的咳嗽、恶心、呕吐、疼痛等不适感。那么病人是会有这些痛苦。如果病人难以忍受这些，就会影响检查和治疗效果，甚至于有时会被迫停止。