巧克力囊肿下腹疼痛是因为质酸化身体发生其他组织的癌变，又因身体机能下降，身体组织液酸化导致的。身体组织液酸化，正常细胞就无法生存，形成真正的肿瘤实体，长期饮食结构、生活习惯不好、心理压力过大等因素造成体质过度酸化的原因。
巧克力囊肿是需要去医院妇科检查的，确诊后是需要考虑手术治疗的，不能忽视问题，一定要及早，不能拖延，不然这样是会出现事情的。同时要检查一下是否有并发性疾病的，是什么原因诱发的囊肿，要做好术后复检消炎工作，在恢复正常前，不能有性生活，也不能吃辛辣以及过于油腻的饮食。
巧克力囊肿症状：痛经是子宫内膜异位最明显的症状，却是最容易忽略的先兆，常进行性加重。这也是一个明显的信号，可能还伴有点状出血，卵巢巧克力囊肿的症状并不是十分的明显。在不孕的女性中，子宫内膜异位造成的不孕占有很高的比例。
巧克力囊肿引起管腔闭塞、囊肿或粘连，均会妨碍精子、卵子或受精卵的运行，致使受精卵到达宫腔产生障碍而发生宫外孕。可以去专业正规的医院进行检查和治疗。日常饮食应以清淡食物为主，多食有营养的食物，如鸡蛋、豆腐、瘦肉等。忌食生、冷和刺激性的食物。
巧克力囊肿是子宫内膜异位症引起的卵巢囊肿，是妇科病，需要挂妇科号就诊的。巧克力囊肿如果超过五厘米以上，是需要考虑手术的，可以在月经干净后去医院B超检查，了解囊肿的大小，结合月经情况，有无怀孕打算来决定治疗方法。
人工流产：女性反复进行人工流产也会增大发生巧克力囊肿的几率，因为在进行宫腔手术时，子宫环境会因为仪器产生的压力而变化，导致子宫内膜碎片随着经血逆流进入盆腔当中，在卵巢扎根后就会随着月经期逐渐生长，最终引起不同程度的巧克力囊肿。