重症肌无力的治疗因人而异，总体来讲，目前比较新的疗法有免疫抑制剂他克莫司的应用，这是一种强效的免疫抑制剂，适用于不能耐受糖皮质激素和其他免疫抑制剂不良反应或对疗效差的重症肌无力病人。
胸腺切除是重症肌无力有效治疗手段之一。重症肌无力是一种由神经-肌肉接头处传递功能障碍所引起的自身免疫性疾病，临床主要表现为部分或全身骨骼肌无力和易疲劳，活动后症状加重，经休息后症状减轻。重症肌无力的发病原因分两大类，一类是先天遗传性，极少见，与自身免疫无关；第二类是自身免疫性疾病，最常见。
多数重症肌无力能治好，单纯眼肌型的重症肌无力用药物调理能治好，伴有胸腺瘤，甲亢等疾病可通过合理的治疗得到临床缓解，胸腺瘤需把胸腺或胸腺瘤切除，甲亢导致的自身免疫紊乱需用抗甲亢的药物。
目前的医学水平无法完全的治疗重症肌无力这种疾病，但是可以通过药物控制病情。重症肌无力症治疗时间要根据病情的具体情况。这属于神经肌的疾病引致肌肉颤动、软弱及容易疲劳。这是一种自我免疫系统的紊乱。
可以选择针灸治疗重症肌无力眼肌型针灸的位置有很多，例如攒竹透睛明、鱼腰、瞳子寥、四白穴、承泣穴、球后穴还有养老穴等都可以作为治疗重症肌无力眼肌型的针灸穴位。针灸主要是先通过辨证分析病情，再选择针灸位置。比如如果属于脾虚湿阻型，则可以选择远端补肾的穴位来进行治疗。
早期在常规治疗后可痊愈而不复发。但治疗前应特别注意检查方法。血、尿、便、脑脊液检查正常。根据检查报告合理治疗，治疗后无复发。需长期口服药物。可在正规医院神经内科检查治疗。