防止甲状舌管囊肿术后复发在手术中需要进行切开引流。
如果出现感染，应在2-3个月后进行瘘管切除，或进行甲状舌管囊肿切除。想要彻底的根治，首先要做好脓肿的切开引流，然后进行外科手术，去除甲状舌管囊肿需要将舌骨的中段和后面的肌肉和舌骨的盲孔全部切除，这样就不会再出现复发的情况了。并且患者在术后还需要做好护理工作，避免出现感染。
甲状舌管囊肿等，必须避免被传染，如反应分泌物，必须及时打扫干净，避免发生感染的状况，甲状舌管囊肿等，或建议尽早手术，特别是无感染时，此时囊肿和周边的分界比较明显，易于完整切除。
一旦发现囊肿内部存在脓液或积液时，需要立即进行清创处理，以免形成瘢痕而影响美观。甲状舌管囊肿等，又称甲状舌管痘，此种情况下的个别儿童，会并发情况，当出现感染以后，需积极的抗感染治疗，等感染得到控制后2~三月，然后再做手术。这样就能有效地防止再发。
由于感染期，囊肿和周围组织的界限不清，难以彻底取出，易导致手术后反复发作等问题，还有甲状舌管囊肿，切忌用手重复刺激，术前可对肿物完善超声检查明确诊断。再是对患者进行心理疏导，让其放松紧张情绪。
甲状舌管囊肿能做微创手术。甲状舌管囊肿主要是触及肿块，其次较大是可以导致疼痛及压迫所致进食梗咽等感觉不太舒适，彩超检查是可以明确诊断，确诊后主要是采取手术，目前的情况手术后可能多少残留疤痕的。
甲状舌管囊肿又称舌甲囊肿，是一种囊性占位性病变，在胚胎发育过程中残留的甲状腺舌管上皮分泌物聚集而成，是一种比较少见的囊性占位性病变，好发于十岁以下的儿童，也可见于成年人，ct表现为颈前部至舌盲孔道的任何一处圆形囊性肿块，多于舌骨周围及舌骨下区。囊内液体囊壁较薄，周围分界较清楚，合并感染的囊壁增厚，增强后囊壁强化明显，需要鉴别诊断1、三点囊肿，一般位于颈部一侧胸锁乳突肌内侧，颈部大血管外侧，颈部的皮样囊肿表现为类圆形低密度影。
甲状腺囊肿是指在甲状腺中发现含有液体的囊状物，甲状腺囊肿通常没有症状，除非囊肿很大或囊肿内有出血的现象，这时可能造成一些压迫的症状，如疼痛、吞咽困难、呼吸困难、声音沙哑等。对于甲状腺病的治疗一定要选择正规医院，以免由于治疗不规范以及服务不周等原因，造成不必要的损害。不要吃刺激性的食物，比如葱姜蒜，香菜，辣椒，酒等和海产品比如鱼虾累等及具有发物的食品，多吃新鲜蔬菜水果，以清淡饮食为主。
甲舌囊肿的手术不是小手术，而是非常复杂的手术方式。
甲状舌管囊肿是先天性疾病，由于颈部受到刺激而引起囊肿包块。症状主要表现为下颌下方、颈部前正中部位有包块，包块可随着伸舌头、吞咽动作而活动，容易触摸到圆形囊状包块。颈部无痛性包块可无明显诱因，常位于颈部正中，多数位于甲状软骨与舌骨之间，随吞咽而上下活动。甲舌囊肿继发感染后会出现局部肿胀、疼痛等症状，需要进行抗感染治疗，多数甲舌囊肿需要手术治疗。