对于子宫内膜不典型增生的治疗，首先要明确诊断，查清原因，若伴有多囊卵巢、卵巢功能性肿瘤、其他内分泌功能紊乱，应行针对性治疗。同时对诊断为子宫内膜不典型增生者即刻开始对症治疗，采用药物治疗或手术治疗。方案的选择对生育的要求，年龄小于40岁者，其癌变倾向低，可首先考虑药物治疗。
子宫内膜的非典型增生是子宫内膜病理活检的结果，如果病人比较年轻，还有生育要求，可以采取保守治疗的方法，就是应用大剂量的孕激素，连续应用3个月或者放置乐环，3个月后再次做子宫内膜癌的病理活检。如果症状没有改善，也可以再继续应用3个月，6个月以后如果没有好转或者病情加重，就需要做子宫全切的手术，避免进一步发展形成宫颈癌。
果患者有生育要求，年纪比较轻，这类患者应药物保守治疗。一使用大剂量高效的合成孕激素治疗。患者没有生育要求，且年纪比较大，可以考虑手术治疗。手术治疗一般选择子宫切除术，术后需禁止性生活及盆浴，且注意休息。
子宫内膜增生就会致使每个月不规则阴道流血，例假周期失调，经期时间纵横交错，经量没有程度有时候多有时少，甚至很多出血或出现血块。有时经期时间持续时间长或几个月不来，偶尔正常期间阴道流血，血量一般都很多，肚子也会伴随着痛，有时经期结束还会出现少数血，或量少淋漓不净，出血期间一般无腹痛或其他不适，出血量多或时间出血，很多人很多出血可致使休克。子宫内膜增厚可以分为正常的子宫内膜增厚和失常子宫内膜增厚两类。
如果子宫内膜属于不典型性增生属于癌前病变，年龄轻，癌变率相对来说可能会低一些，有生育的要求，尽量采取保守治疗，一般是激素配合中药调理，效果不错，需要定期复查，如果效果不好，或者病情加重，需要及时手术治疗。
非典型子宫内膜增生是比较严重的，如果没有及时的治疗很可能会导致月经紊乱或者不规律出血的情况，也可能会诱发贫血的，这段时间还是多休息，观察经期的变化，注意积极加强营养调经。