亚急性甲状腺炎治疗方法应结合患者的具体情况而定，并且患者病情存在个体化的状况，并非所有病人所呈现之症状均一致。
要选择合适的药物来进行辅助治疗，这样才能更好地提高疗效，减少不良反应的发生几率。许多病人就是反应不一样，例如，有些病人颈部疼痛非常明显，部分病人颈部疼痛较轻，但当颈部疼痛显著时或较轻颈部疼痛时均需优先选用非甾体抗炎药进行止疼、消炎治疗，只有当非甾体类抗炎药不能控制病人颈部疼痛的情况时，才能考虑适当增加激素治疗。
一般情况下，亚急性甲状腺炎可以通过日常护理、使用药物等方式进行治疗，具体内容如下：
亚急性甲亢是一种自限性的病症，哈尊和平时注意保暖，避免感冒。少数病人出现了明显的临床表现、炎症面积比较大，如果出现了明显的症状，可以通过一些药物来进行治疗，以防止出现长期炎症。可以口服阿司匹林、布洛芬、吲哚美辛等非甾体抗炎药物。如果疼痛剧烈、高热不能减轻，或炎症范围扩大，可以服用糖皮质激素，建议患者在医生的指导下使用药物进行治疗，以免对身体造成不良影响。
亚急性甲状腺炎不严重。亚急性甲状腺炎简称亚甲炎，是内分泌科的一个常见病多发病，一般多见于病毒感染以后患者出现颈部的疼痛，可以放射至同侧的耳部。极个别严重的患者可以出现发热，一般体温不超过39.0摄氏度，可以伴有周身乏力、酸痛。
亚急性甲状腺炎往往能在一个月内逐渐恢复正常。
具体分为三个阶段。第一阶段，亚急性甲状腺炎可引起病毒感染引起甲状腺大量破坏、甲状腺激素大量释放、早期甲状腺功能亢进症症状，表现为心悸、出汗、消瘦，检查单呈现甲状腺功能亢进症。此时忌吃碘，即不吃海产品，不使用任何抗甲状腺药物。随着时间的延长，进入第2阶段，即临床缓解期，往往最长约1个月左右临床症状消失，化验单逐渐显示患者生命体征平稳，血沉正常。一些患者可以进入第三阶段，即合并亚甲炎和甲减，患者乏力、嗜睡、体重上升，化验单出现甲减。此时，根据TSh的情况，一生都需要用甲状腺激素片替代治疗。
亚急性甲状腺炎的治疗方法主要是对症治疗。
急性甲状腺炎是一种自身局限性疾病，主要表现为发热、甲状腺痛，经过一定的病程病情逐渐自行缓解。患者需要充分休息，如甲状腺痛明显可给予非甾体抗炎药止痛。如果发热体温在38以上，可以给予退烧药。发热、甲状腺痛症状严重，患者无法耐受，可接受糖皮质激素治疗。使用糖皮质激素可以迅速缓解症状，减轻亚甲蓝症状。但糖皮质激素有一定的不良反应，激素在早期停药后病情反复，必须谨慎使用糖皮质激素。
如果是亚急性甲状腺炎，严重疼痛时可以使用非甾体类消炎药来止痛，亚急性甲状腺炎患者服用非甾体消炎药，并不一定能立即缓解疼痛。
部分患者服用非甾体类消炎药后，可能会出现颈部疼痛加重的情况。这时候可以适当使用激素类药物，使用激素类药物治疗后，患者的疼痛症状能够得到有效的控制，同时还可以控制发热，血沉增快的情况，但是需要逐渐减少用量，避免产生依赖性。