在扁桃体隐窝处，会有食物的残渣残留积聚，长时间的不清理，就容易导致细菌感染，细菌的繁殖。久而久之就会形成不容易溶解的钙，镁等无机盐沉积在扁桃体隐窝中，慢慢就形成结石。如果不注意刷牙漱口，不注意清理的情况下，容易得扁桃体结石。
小孩化脓性扁桃体炎主要是由于链球菌感染引起的，首选青霉素类的药物，如果宝宝症状比较轻，精神好，食欲好，先给宝宝采取口服消炎药物，超过38.5°口服退烧药物，低于38.5°物理降温，同时让宝宝多喝水，配合消炎的口服液。如果超过三天，体温持续不退，而且宝宝出现了咽痛明显，必要的时候就要采取输液治疗。至少需要三到五天左右。
扁桃体炎引起发烧需要到医院进行治疗，还可以选择物理降温的办法，对于头部温度的控制也就是非常重要的，使用湿毛巾敷前额就是非常好的办法，还可以使用低温等离子消融技术。
需要将白斑连同扁桃体一起切除，常用等离子下扁桃体摘除术。扁桃体如经常发炎，可以引起扁桃体上面有白色的斑块状物附着，反过来扁桃体慢性炎症又再次刺激白斑的生长，两者互为因果。
扁桃体结石小结石可用刮勺或钳子取出，个别的可用负压吸引取出，大结石在表面麻醉下切开粘膜取出，但需要防治坠入呼吸道。如果是酸性结石可以喝碱水排出，碱性结石可以喝酸性水溶解排出。
