可用冷冻、微波处理，但范围不宜过广以免引起黏膜萎缩。治疗时需去除病因，限酒戒烟，避免粉尘及有害气体刺激。积极治疗慢性炎症，如治疗鼻炎、鼻咽炎等，局部可口服相关口服药。
慢性咽炎淋巴滤泡增生能消除，这种疾病是一种常见病，特别是有烟酒嗜好的人更多些，当然经常受到环境污染（如粉尘、化学性气体刺激）的影响也会出现类似症状。一般不会恶变。
慢性咽喉炎需要做喉镜检查，因为慢性咽炎主要的表现就是在口咽部用肉眼就能看到，咽部的黏膜慢性充血，有淋巴滤泡的增生，对于慢性的喉炎，肉眼通常不容易看到，早期使用间接喉镜看。
做喉镜检查是没有痛苦的，但是患者会有轻微的恶心及呕吐。所以说在检查之前要使进行咽喉部的表面麻醉，抑制咽反射，同时还需要使用收缩下鼻甲以及表面麻醉鼻甲以及鼻腔粘膜，检查时使用纤维喉镜，缓慢从鼻孔插入，查看鼻腔粘膜，鼻中隔，下鼻甲，鼻咽部以及咽喉部等各个组织，是否存在炎症水肿充血，或者是异常新生物。
咽部淋巴滤泡增生引起的吞咽困难，经过积极治疗后，一周左右能好。
咽部淋巴滤泡增生导致的吞咽障碍并不是很严重，当咽下有急性炎症后会有咽痛感，吞咽时会有强烈的痛楚，如果经过紧急的处理，症状缓解后会很快得到缓解，通常会在一星期左右。咽咽喉部位有阻塞感、异物感等，是由于咽咽喉的慢性炎症所致的淋巴滤泡增生，一般不会有明显的吞咽障碍。若病人连续吞咽困难，无明显的喉咙痛，应做好喉咙和消化道的全面检查。
慢性咽炎，如果已经确诊，通过间接喉镜检查，一般可清楚观察到咽喉部，若声带及会厌等部位无明显异常时，无需再进行喉镜检查。但抽烟、喝酒、肥胖或消化不良、舌体肥厚等，间接喉镜检查，有时无法观察全面，需通过喉镜检查，排查是否因其它原因引起咽炎。