由于部分脓肿位置较深，病变多发生在神经支配的区域，疼痛常常不明显，一般表现为坠胀，坠痛或者直肠刺激的症状。恶寒、发热，全身酸痛不适等感染性症状。尤其是提肛上脓肿，病变初起时就有全身症状，肛门局部不明显，所以导致疾病难发现。
包皮裂口最初的症状有以下：触碰包皮，会感觉到轻微的疼痛和难受，包皮微微绽开，像有一道口子。如果是外伤造成的包皮裂口，要休息，注意做好消毒消炎措施，涂抹药膏，如严重尽快到医院治疗。
刚开始的时候就是有点疼痛，但是轻微的，也不是很疼，但是慢慢随着发展，如果遇到天气变化，那么疼痛感就会增加，如果平时工作很累，那么疼痛感也很大。当肩部偶然受到碰撞或牵拉时，常可引起撕裂样剧痛，肩痛昼轻夜重为本病一大特点，多数患者常诉说后半夜痛醒，不能成寐，尤其不能向患侧侧卧，此种情况因血虚而致者更为明显，若因受寒而致痛者，则对气候变化特别敏感。
肛周脓肿会出现肛周局部红肿症状，伴有强烈的疼痛感觉，而且疼痛呈持续性，与体位和排便无关，若疼痛症状严重，甚至可以引起排便和排尿困难。严重的肛周脓肿炎症细胞入血，白细胞显著升高，还可以引起全身发热症状。
肛周脓肿的最初症状主要表现为红肿、疼痛发热等，在未形成脓液时可以应用抗生素药物治疗，以及局部热敷，如已形成脓液则需切开引流换药治疗，可考虑进行彩超检查或无菌注射器穿刺以判断是否形成脓液，保持肛周清洁卫生，忌辛辣刺激性食物。