巧克力囊肿属于子宫内膜异位症的一种，又称外源性子宫内膜异位症，巧克力囊肿是子宫内膜异位到卵巢部位发生的一种蹭，这种病症反复发作，严重影响的正常生活。早发现，早治疗还是可以避免的。
发现患有巧克力囊肿的时候一定要积极的进行手术的方式治疗，因为手术的方式治疗卵巢巧克力囊肿是目前为止能够较为彻底地清除囊肿的一种治疗方式，而且通过手术的方式还可以有效的缓解痛经，提高生活质量，对于有不孕症的病人，手术之后妊娠率能够得以提高。
平时在饮食上多进行调理，不要吃刺激性太强的食物，多吃一些清淡易消化的食物比较好。保持乐观的心态，少生气，良好的精神状态能够让免疫系统正常，有防止巧克力囊肿复发的作用。
子宫内膜异位症切除了子宫的话，子宫上的病灶可以得比较好的治疗，但是卵巢或者是盆腔里的异位灶还是有可能会复发的。如果巧克力囊肿不是特别大，没有什么异常的症状，可以采取肌肉注射的方式治疗看一下包块能不能消除，这个针比较贵，可能需要打三到六个月。
卵巢巧克力囊肿是由于子宫内膜异位到卵巢上生长而导致形成的，一般卵巢巧克力囊肿会引起进行性的痛经，同时可能影响怀孕甚至导致不孕，当卵巢巧克力囊肿小于五公分以下，又没有明显严重痛经的时候，可以考虑采用短效避孕药来进行调理治疗，如果是卵巢巧克力囊肿大于五厘米，我们通常建议直接行腹腔镜手术切除囊肿才行。
确诊后宜立即手术，因流出的囊液可引起盆腔粘连、不育或异位内膜的再次播散和种植。年轻未生育者在吸引和彻底冲洗吸引溢入盆腔内的囊液后，做囊肿剥出术，尽量保存正常卵巢组织，对维持卵巢功能和内分泌功能有助，对日后增加孕育机会也有助。
