咳嗽伴有低热可能是病毒感染引起的系统性疾病，如真菌感染的早期或者病毒感染，还有支原体感染，比如风湿免疫系统疾病或者血液系统的疾病，或者神经中枢有疾病等。
如果出现咳嗽持续低烧，常见于肺结核引起的，尤其是午后低烧，合并有盗汗、乏力、纳差、消瘦，咳嗽、咳痰、咯血、胸痛、不同程度胸闷或呼吸困难等症状者。通过检查结核菌素，血常规，胸片或者胸部CT可以确诊。确诊后需要积极抗结核治疗，一般需要一年左右，治疗后复查。继发性肺结核或者空洞型肺结核是有传染性的，需要加强防护及隔离。平时戒烟酒，避免接触过多粉尘或者烟雾。
宝宝咳嗽低烧，需要有良好的周围环境，多饮水，补充维生素c，注意休息，防止交叉感染及并发症。可以口服一些药物来对症治疗。如果是病毒性引起的，给予抗病毒药物对症治疗。如果是细菌性引起的，给予抗生素药物对症治疗。如果孩子精神比较差，出现高热惊厥，建议到小儿科诊治，必要时住院治疗。
宝宝咳嗽发低热，很可能是呼吸道感染，病毒感染造成的，也有可能是感染性的结膜炎的情况，由于孩子年岁比较小，所以还是尽快到当地的大医院做一个详细的检查，明确病因后在医生的指导下对症治疗，平时要对孩子做一个定期的体检。
咳嗽、低烧，西医上认为是细菌或病毒入侵引起的上呼吸道感染症状，所致的发烧加重，形成肺内炎症引起的咳嗽现象。极少部分患者是慢性消耗性疾病所致，如肺结核及肺部肿瘤占位。
咳嗽低烧可能考虑受凉引起的，宝宝在医生指导下口服感冒药和消炎药，在配合止咳药物治疗，一般需要给宝宝多喝温开水，注意不能受凉，需要注意保暖，如果病情没有缓解，也需要带宝宝去医院。