由于颈部解剖复杂、血液丰富，甲状腺手术后的并发症除常见的手术发生出血、呼吸障碍等外，还可能出现以下并发症：
1.喉上神经损伤，甲状腺上极，大张处理结扎甲状腺上动脉，可能不小心刺伤或切除喉上神经，引起声带松弛、环甲肌麻痹。
2.喉返神经损伤在处理甲状腺外侧或下极时易损伤喉返神经，引起声嘶。
3.手足抽搐，手术时误切甲状旁腺可引起低血钙症状，出现手足麻木、抽搐。
4.甲状腺中毒危象，手术时大量甲状腺激素进入血液循环可能诱发甲状腺功能亢进危象。
5.甲减、甲状腺组织切除过多，残留甲状腺功能不足导致甲减。
6.甲状腺功能亢进症复发。
甲状腺切除术后影响怀孕：
甲状腺切除后，是影响怀孕的。因为甲状腺切除之后，甲状腺功能低下，有可能导致排卵障碍，会引起不孕。所以，在甲状腺切除术后，要外源性的补充甲状腺激素，进行治疗。比如可以服用优甲乐、雷替斯等，进行补充治疗。需要定期的复查，甲状腺切除术后，若是怀孕，还会影响胎儿的生长发育，影响胎儿的神经智力发育。
一般情况下，甲状腺切除术后需要休息10天左右。
如果患者需要进行甲状腺切除术，术后一般休息10天左右就能上班，这是因为甲状腺切除术主要是在颈部甲状腺部位进行，对身体的干扰不大，因此术后很快就可以恢复。在日常生活中，患者需要养成良好的生活习惯，保持饮食清淡，少吃辛辣刺激性食物，如辣椒、芥末等。同时还可以进行体育锻炼，如慢跑、跳操等。
甲状腺全切除后，手脚麻木1周左右即可恢复，但也可服用甲钴胺片、维生素B1片等营养神经的药物促进恢复。
如有甲状腺结节性病变，或确诊为甲状腺癌，往往需要甲状腺大部切除或全切除术，一般甲状腺手术切除后可能影响神经和血管出现手足麻木症状。甲状腺位于颈前，故其周围有较多神经血管及重要脏器分泌物，手术后并发症较多，对手术者要求也较高。如果有喉返神经损伤，患者会声音嘶哑。如果是喉上神经损伤，患者容易饮水呛咳。甲状腺切除时切除甲状旁腺，钙磷代谢异常，尤其是发生低钙惊厥，出现手足麻木的概率相对较低。
甲状腺手术后当日，患者须禁食。手术第二天，可以吃流质食物。第一次饮食，要注意不要呛咳，不要吸入肺部。
甲状腺手术后可食用牛奶、蛋黄、鱼、油菜、芥菜、猕猴桃、香菇、蘑菇、木耳、核桃、薏苡仁、红枣、山药。这些食物有消肿、提高免疫力的作用，对甲状腺手术后的恢复有很好的作用。不要吃辛辣、油腻、碘含量过高的东西，注意饮食节奏，养成良好的生活习惯。
甲状腺大部切除术后易出现以下并发症：
第一、术后甲状腺功能减退表现为肢体水肿或粘液性水肿，应及时补充甲状腺激素片治疗。
第二，手术中出现甲状旁腺损伤，术后出现手足麻木、口周麻木、进一步抽搐，表现为低钙血症，应及时补充钙制剂，手术中应注意谨慎操作。
第三，甲状腺术后易合并出血，是因为供养血管非常丰富，结扎线脱落也会诱发出血事件的发生。第四，单纯结节性甲状腺肿易发生术后复发，术后需定期随访观察。