小孩做扁桃体手术，其利弊要根据是否影响小孩发育情况来判断。
通常扁桃体在15岁前有能正常杀菌、抗炎，应尽量选择保守治疗，不建议首选手术治疗。若扁桃体反复发炎，如在1年内反复3次发炎，伴有化脓性扁桃体炎，扁桃体附近脓肿，睡觉有时打鼾、憋气的情况，此时建议进行手术治疗。扁桃体反复发炎，会导致心肌炎、肾炎等相发症，有这些症状时建议手术治疗。
包皮过长会使龟头不能完全外翻，也不能露出尿道口。会导致细菌感染，影响阴茎的正常发育，影响性生活，导致排尿困难、龟头炎等。同时也会增加女性阴道炎的发病率。因此，如果有包茎，需要手术切除。这可以防止各种疾病的发生。
如果孩子包茎过长影响阴茎发育，可以在早期做包皮环切术，但如果只是出现包皮过长，可以先不做包皮环切术，在10-15岁期间进行即可。
如果有包皮过长，可以定期上翻和清洗，但要注意上翻清洗后再进行包皮复位，避免出现包皮嵌顿。包皮手术虽然不大，但也会对孩子的成长造成很大的影响。所以，在做包皮手术时要慎重。临床上也有研究显示，20岁前做过包皮环切术的儿童与20岁以上做过包皮环切术的儿童，其发生率比较无显著性差异。所以，在病理学变化尚未到达真皮层，且细胞结构尚未发生变化时，儿童包茎手术可以在10-15岁期间进行。
虽然男性生来包皮过长，但随着孩子的发育，阴茎会慢慢生长，包皮会逐渐缩小。如果孩子八岁时包皮不会随着阴茎的生长而收缩，那么可以切除包皮进行治疗。在孩子停止发育前切除包皮有助于避免阴茎短小的危害。如果孩子的自控能力更好，可以在六或七岁时切除。切除合适的时间是八岁。但不要超过十六岁，因为阴茎在十六岁时会迅速发育。
小孩有包茎或包皮过长的话会影响里面的发育，这样会对以后有影响，可以及时进行手术切除，是属于外科手术，可以去医院外科挂号，手术后2到3周左右，症状就可以完全恢复。另外孩子的这种病症，一定要早期采取措施。否则孩子进入青春期之后会影响阴茎龟头的发育。
小孩生殖器囊肿通常是皮口或尿道外口。
包皮口囊肿在包皮交界处，治疗以手术切除为主，若包皮囊肿较大，建议进行包皮环切。若囊肿在尿道外口，建议进行囊肿剪开或剥离，创面要垫住缝合。囊肿具体病因不明，是一种良性病变，切除后没有不良的反应，术后要留置尿管预防，预防切口感染，感染会难以愈合，容易形成瘢痕。也可以选择注射治疗，生殖器部位不建议用注射治疗，防止不良反应。通常囊肿不会很大，早期可以观察，多数预后良好。