重症肌无力合并胸腺瘤最简单的治疗方法就是手术，手术过程当中可以有效改善这两种疾病的症状，同时在日常护理方面也要有战胜疾病的信心，积极配合医生的治疗，定期复查，防患于未然。
两病均与人体免疫功能紊乱有关。甲亢患者往往存在着自身免疫性甲状腺病，而自身免疫调节失调又可能导致其他多种疾病发生。甲亢伴重症肌无力，临床多见，二者并发，本病无一个特定病名，通常应分别诊治。
重症肌无力属内分泌系统中一种较为特殊的疾病，主要是因为自身免疫性疾病所导致。重症肌无力是神经内科中的一种典型病症，由于机体的免疫功能紊乱，产生异常抗体，影响突触后膜上乙酰胆碱的受体，从而阻碍神经冲动传递。另外一种情况就是由于自身免疫系统失调导致全身感染，出现全身性炎症反应综合征，这种时候就容易发生多器官衰竭。治疗上一般给予病人糖皮质激素、免疫抑制剂及其他治疗，预后尚可。还有部分病人并发胸腺瘤，手术干预是必要的。
还有一些患者患有自身免疫性肝炎，这类病症会造成肝纤维化，最终发展成肝硬化，对人体健康造成危害。甲亢的发生还由于免疫功能紊乱，产生异常抗体所致，致使甲状腺受到损害而发生病变。
肌无力主要表现为全身的骨骼肌无力，容易疲劳，劳累后症状加重，休息后症状减轻。治疗主要是根据原发病针对性的治疗，首选药物是抗胆碱酯酶的药物或者使用免疫抑制剂。
重度肌无力不能治好，需要长期服用药物控制病情，在急性发作期，通过服用药物使发作尽快结束，在缓解期，服用些药物避免重症肌无力的复发，重症肌无力同高血压、糖尿病一样，都是通过服用药物控制病情，在不用药的情况下较易受到自身免疫相关抗体的攻击，出现病情加重。
胸腺切除手术，但是胸腺切除手术也有适应症，主要是用于有胸腺异常的人，是适用于十六到六十岁之间发病的全身型没有手术禁忌症的重症肌无力患者，大多数患者在胸腺切除后，可以显著改善症状。另外有一些效果也比较明显，比如静脉注射免疫球蛋白，可以综合自身抗体，调节免疫功能。