手足口疫苗最佳的注射时期建议在冬季末应用。南北方是有差异的。手足口疫苗一个疗程共注射两次，两次间隔一个月，需要在二、三月份注射；南方一、二月份注射，这样在春季末，温度升高季节已经注射完毕。因为婴幼儿感染，手足口重症发生率高，所以婴幼儿12个月以前完成接种。六个月到五岁的婴幼儿及儿童都应该注射。
小孩在刚出生后24小时内就要接种卡介苗和乙肝疫苗，具体分析如下：
一月龄接种乙肝疫苗，2、3、4月龄接种小儿麻痹疫苗，3、4、5月龄接种百白破疫苗，6月份接种乙肝疫苗，8月份接种麻疹疫苗，1.5-2周岁接种百白破和麻疹疫苗。事实上，疫苗的具体日期并不是每个接种地点都会在注射完后进行，所以父母们可以按照预定的时间进行注射。此外，最好在早上进行疫苗注射，一旦出现疫苗的反应，很可能会在晚上发生。
如果患有轻微的感冒症状，最好不要接种疫苗。由于大多数的疫苗属于减毒的活性物质，注入身体后可能会诱发出现炎症反应，导致感冒的症状加重，引起身体的不适。一般不建议在感冒期间接种疫苗。待症状完全痊愈后再进行疫苗的接种。避免产生接种疫苗后的副作用，影响到生体健康，导致出现发热、咳嗽、恶心、呕吐等症状。
宝宝刚出生需要接种乙肝疫苗和卡介苗，在出生的医院由防保科打，出院后所有的疫苗应当到居住地卫生院防保站打，临时串门到外地，也可以在外地的卫生院防保站打。
手足口疫苗要接种两针，中间间隔一个月，但是不是保证接种手足口疫苗后以后绝对不会患上手足口病，而是增强了手足口病的抵抗力，能降低孩子患上手足口病的概率。
手足口病的疫苗主要是在五岁以下、六个月之上的孩子进行注射。手足口病的疫苗注射上之后，能够防止肠道病毒71型的感染，但是需要注射两针，出现重症的可能性也不大了。当超过五岁之后，没有必要再注射手足口病的疫苗。