一般情况下，肛周脓肿患者初期，可出现肛门不舒服、胀痛或疼痛等症状，特别是排便后，患者还可出现烦躁、还不规则低热等症状，这是因为肛周脓肿多由肛腺反复感染引起，常见于免疫力低下或患有糖尿病的人。正常情况下，肛周脓肿都比较容易治愈，但如果治疗不彻底的话就可能出现复发问题。因此，建议肛周脓肿的患者应及时就诊，在医生指导下进行治疗。以免影响身体健康。
肛周脓肿较难，该病为肛周特殊部位感染，即肛门部肛腺感染，沿皮肤和黏膜间隙潜行扩散，故有别于体表疖、痈感染。因皮肤和黏膜比较牢固，不易突破，故局部或全身用药很难控制，微小肛周感染，可通过局部坐浴，口服消炎药。
如果是湿疣，要积极治疗。治疗原则，局部用药，每天涂药几次，肛周湿疣比普通湿疣治疗时间要长，但坚持治疗一样可以治好，不需吃药打针挂水等全身性治疗，激光、冷冻等常规的物理方法治标不治本，单独用多在短期内复发，可配合伤口涂药治好。
抽脓减压局部消毒，可暂时减轻脓腔张力，缓解疼痛，适用于临时应急处理，但不能代替手术。切开排脓属于暂时性应急处理。可排出脓液，迅速减轻症状，但不能代替治疗术，一般约需3个月左右，待瘘管形成，内口明确，再行治疗术。为进一步减少手术创伤，可采取双向等压引流手术治疗，术中采取半切割挂线，并放置引流管，可不切断肛直环而使脓腔愈合。
会引起孩子发烧，大便不好。肛周脓肿也可直接影响直肠和肛门，导致发生消化不良，甚至可能引起便秘。肛门肿胀和疼痛。随着病情的发展，会逐渐出现肛门肿胀和疼痛，会给儿童造成很大的疼痛，如果不及时治疗，这种疼痛会逐渐加重，从而导致儿童食欲下降、失眠等症状。
肛周脓肿的病人早期会表现为肛门不适，发胀或者有疼痛的表现，尤其是在排便以后，病人也会表现为坐立不安，也会有不规则的低热，因为肛周脓肿的发生原因，主要是由于肛腺的反复感染所导致的，也可以见于免疫力低下或者有糖尿病患者。