同房第三天后吃避孕药有一定的作用。
一般情况下，紧急避孕需要在同房后的72小时内服用，并且服用的时间越早，避孕的机率也就越大。如果在同房三天后才服用避孕药，虽然也具有一定的效果，但是并不能保证避孕的机率。并且，服用紧急避孕药会具有一定的副作用，比如头疼、头晕、撤退性出血等，甚至影响到正常的月经。所以如果生育计划，在进行同房时最好进行正确的避孕。
避孕药第三天吃有用，通常使用的是紧急避孕药，具体分析如下：
在性生活后的第三天服用避孕药也有效果。避孕药的作用是在性生活后72小时之内，而且越早服药，避孕效果会更好。如果避孕药在第三天使用，并且在72小时内，则是有效的。如果超过72小时使用紧急避孕药的话，药效就会大打折扣。另外，避孕药的避孕效果也不是100%，如果一个月来月经推迟，还需要做尿妊娠试验，以排除意外怀孕。
一般来说，当服用紧急避孕药之后，在未来一周左右可能会出现撤退性出血，当撤退性出血完全干净以后，通常就可以同房了。如果还没出现服药后撤退性出血的出现，就想要同房，那么建议在同房过程中可以全程使用避孕套，尽量做好安全措施，可以降低受孕的几率。如果服药之后出现月经推迟一周以上的情况，那么还要排除怀孕的可能。
怀孕期间不能服用任何药物，如果怀孕后服用避孕药，剂量较小，一般情况下不会有任何问题。如果服用避孕药时间过长，可能会导致胎儿畸形，甚至是流产。
如果胎儿有畸形或者智力发育障碍，需要做清宫手术或者药物流产，因为怀孕以后，孕妇身体状况会发生变化，体内的酶会影响某些药物的代谢过程，而胎儿处于生长发育阶段，如果在怀孕初期使用药物，会导致药物在胎儿体内吸收。
吃了避孕药后可以吃维生素C含量多的水果。如猕猴桃，橙子，柚子，苹果等。
通过用维生素C加速避孕药的代谢、降低避孕药的副作用，紧急避孕药属于高效的孕激素，会影响体内的内分泌，导致内分泌失调。吃完紧急避孕药后可能会胃肠道不舒服、乳房胀痛白带异常、月经紊乱，要规律作息，清淡饮食，同房14天后，可用早孕试纸测尿液，排除怀孕的可能性。
通常情况下，吃了避孕药不会怀孕，但也有可能怀孕。
避孕药只是起到一定的预防作用，但不能100%的预防，若女性是受孕体质，服用之后不能达到抑制生育的目的，到时候就有可能会怀孕。不过一般情况下服用紧急避孕药之后是不会怀孕的，即使会怀孕这样的几率也比较少。建议短效避孕药或者避孕工具来避孕，经常性口服紧急避孕药并无益处。