临床数据表明，慢性炎性疾病会受 到月经周期和怀孕的影响，故雌激素可能在预防慢性炎性疾病中发挥作用。一些严重的炎症改变性疾病，如骨质疏松症、动脉粥样硬化、糖尿病及其他代谢性疾病、 关节炎和其他提示了卵巢功能的衰退。雌激素水平较高的个体此类疾病发生率较低。研究表明，血液循环中的雌激素可靶向作用于单核细胞谱系、减轻相应的免疫反 应。
单核细胞/巨噬细胞是具有 特殊可塑性的细胞，可及时保护宿主免受有害事件和恢复组织内稳态。在这其中，转录组和蛋白组会发生重要变化：炎症刺激（来源于病原微生物、受损组织或激活 的淋巴细胞）诱导巨噬细胞获得炎性极化或快速激活NF-κB信号和促炎细胞因子的合成和分泌，如TNFα、IL1β、IL6、IL12、IL23以及趋化 因子，如单核细胞趋化蛋白(MCP1)。这些炎症化合物可增加细胞毒性介质如诱生型一氧化氮合酶（iNOS）的表达，同时也会增加受损组织或病原微生物的 吞噬作用、巨噬细胞的迁移和招募相关蛋白酶的表达。
这一事件的最终解决方式为依靠巨噬细胞、其他免疫细胞实现的平衡免疫反应、修复受损组织、恢复功能等。巨噬细胞可促进T淋巴细胞特定抗炎细胞因子的合成和分 泌(IL4、IL13),最终抑制促炎细胞因子（TNFα, IL12, and IL1β）和诱导型一氧化氮合酶（iNOS）的产生。
最近的研究表明,巨噬细胞也可激活一种内部程序进而转化为抗炎表型，相关的炎症反应与“获得失活”或分泌IL10、TGFβ因子为特征的M2c表型相关，合成的化合物可负责维持组织内稳态、修复受损细胞、细胞增殖、结缔组织重组和血管生成。
评估雌激素参与的内在或T细胞调节的巨噬细胞在炎症反应中的作用，发现雌激素与炎症发生的信号相关、可缩短促炎症阶段的持续时间、减弱炎症作用，并发现新型雌激素受体调节剂可有效预防或缓解慢性炎症。
来自的意大利米兰大学药理和生物分子科学Alessandro等研究团队前期实验发现，啮齿类动物的巨噬细胞可表达经典的雌激素胞内受体α和β（(ERα和 ERβ）。膜结合G蛋白偶联的雌激素受体(GPR30 / GPER-1) 同样也有发现在小鼠巨噬细胞中表达。ERα相关的雌激素可减少促炎化合物的合成、控制线粒体有丝分裂和呼吸作用、通过蛋白酶体诱导受损蛋白质的降解，减少 单核细胞凋亡和激活缺氧基因。在分子水平上，激素激活的ERα损害通过阻止核转运使NF-κB转录活动受损，表现为脂多糖（LPS）诱导的炎症反应。雌激 素依赖型的NF-κB 转录抑制激活作用不需合成蛋白以调节IκBα降解蛋白质合成，而是通过激素激活的ERα与磷脂酰肌醇(-3)激酶之间发生的直接交互作用。胞内ERα、 ERβ除了充当激素调节转录因子外,还可能与负责信号转导和干扰的胞质和胞核蛋白质相互作用。除了胞内受体，膜结合GPR30受体可能通过准确作用于 GPR30特异性受体激动剂，调节巨噬细胞表面的表达toll样受体4(TLR4)的表达，参与雌激素抗炎作用。
