美国联邦政府的大型个体化癌症医学试验遇到了未曾预想到的障碍：很多肿瘤样本无法完成基因分析。来自晚期癌症患者的样本由全国几百个临床诊所的医生收集。当研究者对这些样本进行检查时，发现1/5的样本没有足够的恶性细胞用于分析，因为大部分情况下，活检进行得很差。
这种故障引发了精准医学新时代的问题。
在乡村或社区中心进行的活检更容易出现劣质的情况。无法分析这些患者的肿瘤样本，并且也无法与以特异性基因突变为靶点的药物相匹配。
由此提示，先进的、个体化的癌症治疗的机会可能非常不平等，并且依赖于当地医生活检技术的高低。试验的研究者冈德森卫生系统的Kurt Oettel医生说道：“我们发现组织样本的质量确实在不断波动，这个问题给癌症治疗造成了巨大挑战，我认为这是对每个人来说都是一个新的认识过程。”
去年8月份由美国国家癌症研究所发起的MATCH试验被誉为是“到目前为止规模最大、科学上最严谨的精准医学癌症试验。”这项试验是奥巴马政府投资2.15亿的美元精准医疗计划的一部分，目的在于根据患者的基因情况为患者定制治疗来驱动医疗卫生改革。
这项研究的启动引起了巨大反响，近800例患者迅速加入了这项试验，该试验计划纳入3000例患者。在去年11月，因为试验的预期花费至少为3千万美元，研究者暂停了这项试验。
研究者说，他们想先暂停试验，需要好好想想试验如何进行。但是领导该试验的肿瘤学家Keith Flaherty医生并没有预想到期中分析会显示出这么突出和频繁的活检样本的质量问题。
劣质的活检样本扰乱患者的治疗
操作规章要求收集微小的肿瘤块并且邮寄到中心实验室进行DNA提取。医生用中空的活检针取出直径大约只有自动铅笔芯大、大约1寸长的肿瘤样本。
试验研究者应该从每例患者中收集4例这样的“核心”组织。不过很多时候，安德森癌症中心的中心实验室的技术人员只能得到1个或2个这样的组织。即使有足够的核心组织，样本的质量也常常比较差，只包含非常少的肿瘤细胞。
总体来看，10-20%的样本没有足够的用于DNA检测的癌组织，Flaherty说道。他发现，这项低于标准的活检样本多半是来自比较小的、乡村治疗中心，虽然有很多也确实来自主要学术研究医院。
这些不严谨的活检样本确实对患者产生了影响。
MATCH试验的入组标准要求癌症患者尝试过所有的标准治疗。所以这项试验是这些患者的最后机会。
但是糟糕的活检意味着他们无法与个体化治疗相匹配。随着时间的流逝，他们拼命想抓住救命稻草。很多患者尝试更多的化疗，但通常这些尝试都是徒劳的。其他患者积极寻找检验其他治疗方法的临床试验。有些患者就直接进入了临终关怀。
活检理念的变化
给癌症患者做活检的医生是介入放射科医生。这些专家在微创医学领域已经开发了很多操作规程。对于癌症患者，他们传统的工作就是获取病理学家诊断所需的尽可能少的组织。
获取的组织越多，患者的风险越大，因为每次医生回来用活检针取样都会增加患者流血、感染或者病情恶化的风险。
但是精准医学颠覆了这一点：更多的活检组织意味着更多的治疗获益，因为只有更大和更加深入的活检组织才能提供患者个体化治疗需要的基因信息。
“你有这样一个矛盾的问题：努力减少治疗过程中的毒副作用，并努力得到最优的样本组织。”威斯康星州的肿瘤学家和美国临床肿瘤学学会的社区研究论坛理事会主席Michael Thompson医生说道。
此外，像MATCH试验中的个体化治疗方案不仅需要首次诊断的活检组织，很多时候在每次肿瘤获得新的耐药突变导致治疗失败时也需要患者的活检组织。
“你需要在想要知道患者疾病情况的时候获取样本组织，错过了就没有了。”Oettel说道。
Flaherty希望介入放射科医生能更好的进行训练，从而能改善活检
“这就是我们从执行一项全国大型试验中学习到的主要内容，”马萨诸塞州综合医院的靶向治疗亨利和贝琳达特米尔中心主任Flaherty说道。
不过有些社区医疗拥护者对试验领导者将他们的乡村诊所认定为引起问题的地点而感到不满。
“我可以告诉你们：每个机构的样本质量都是差异很大的。”健康使命网站的个体化医学主任Lynn Dressler说道。她呼吁在得出结论前能有更多的数据公布。
“将差异归为学术机构和社区医院之间的差异确实导致了对整个区域和个别地方之间的不公平。”她说道。
健康使命网站是众多即将开始登记MATCH研究的患者的网站之一，只要试验的纳入工作暂停，网站就马上开始患者的登记工作。这项工作原来打算这个月开始，但是开始时间推迟到了4月或5月，同时“这项试验也正在进行很多调整”，国家癌症研究所上周在其官网公告中说道。
