英属哥伦比亚大学BC儿童医院的科学家们通过全基因组测序精确诊断了一些智力障碍背后的遗传疾病,发现了与已知疾病有关的新基因、新体征和新症状。这一突破性成果五月二十五日发表在顶级医学期刊《新英格兰医学》上,首次展示全基因组测序能够改变智力障碍儿童的一生。
智力障碍是一个比较复杂的问题。有些儿童的智力障碍是因为某种罕见遗传病干扰了机体的代谢功能。这种代谢障碍会使大脑和机体出现能量缺陷和有毒物质累积,最终导致发育迟缓、认知缺陷、癫痫和器官功能不全。在细胞水平靶标代谢紊乱对这类疾病是很有帮助的, 比如调整膳食、补充维生素、服用药物和骨髓移植。早期干预能为这些患儿提供很大的帮助,显著改善他们和家人的生活质量。
BC儿童医院的数十名儿童可能就遇到了上述问题,但传统方法无法给他们确诊。研究人员对这些患儿及其家人进行了代谢组学分析和全外显子组测序。他们在此基础上确诊了68%的患儿,为40%的患儿提供了有针对性的治疗。
研究人员通过测序发现了一种新遗传疾病——碳酸酐酶VA缺乏症。这种疾病出现在幼儿时期,患儿无法正确分解蛋白导致体内血氨过高,最终引起致命的嗜睡和昏迷。研究人员指出,药物carglumic acid能够防止这种疾病造成大脑损伤。研究人员还发现了一种新代谢疾病——谷草转氨酶2缺乏症。这种疾病主要影响大脑,表现为小头、癫痫和发育迟缓。用丝氨酸和维生素B6治疗可以改善患儿的症状。
利用新一代测序(NGS)来做出诊断,在如今的诊疗机构中越来越普遍。由Illumina、赛默飞世尔和Pacific Biosciences的测序仪所推动,临床实验室正在生产大量的DNA序列数据。因此,研究人员和临床遗传学家发现将医学谜题转化成临床行动比以往更容易。
过去研究者们常通过全外显子组测序检测致病突变,不过全基因组测序的成本也越来越低,究竟哪一种方法更好用呢?洛克菲勒大学的Alexander Bolze(现在在加州大学)和同事对这两种方法进行了比较,并将结果发表在最近的美国国家科学院院刊PNAS杂志上。
华大基因研究院、广州医科大学附属第一医院等处的研究人员报告称,他们首次完成了对亚洲患者原发性及转移性肺腺癌的大规模测序。这项研究发布在Nature Communications杂志上,为肺腺癌的个性化医疗奠定了基础,有助于阐明转移性肺腺癌的分子机制。