尽管神经调控治疗意识障碍的初步研究显示出良好治疗效果，但国内外处于实验性研究阶段，缺乏大样本系统性研究，在关键科学问题上存在瓶颈，亟待解决。
1. 意识状态客观评定方法的标准化：选取治疗人群缺乏客观指标及标准，治疗结果不稳定，缺乏可比性及重复性；基于多模态神经影像及EEG的脑网络研究是目前最为可靠的评定意识状态客观方法，但其特异性和灵敏度仍然存在问题。
2. 准确有效的临床实施方案：①神经调控的靶点选择：无论是DBS、SCS、TMS均需选取治疗的干涉部位。但目前尚无经大量样本验证后确切、有效的靶点。BCI目前尚不能对全脑信号进行捕捉及分析，现阶段仅能提取功能区皮层特征脑电信号。②准确定位及有效实施：尚无精确植入所需的目标靶点细胞电生理特征及定位手段，治疗效果无法保证。③选择正确的电、磁脉冲参数：目前基本以经验调整为主，缺乏科学性证据，需要建立符合循证医学要求的客观指标检测依据及调整方式。④脑电信号提取及模式识别：BCI技术的关键步骤是DOC患者EEG特征提取及准确识别，加之合适的信号处理与转换算法，使神经电信号实时、快速、准确的通过BCI系统，转换成可被计算机识别的命令或操作信号。但是其针对DOC的研究极度缺乏，限制了多种新型治疗技术的使用。
3. 设备的集成及小型化：BCI技术的核心是把脑电信号转换成输出控制信号或命令的转换算法。在初步建立基于EEG人机交互意识交流后，需要完成设备的集成及小型化，逐渐发展为可穿戴或便携式设备，以适应患者重返正常生活环境，长期使用的要求。
目前在WHO公布的DOC神经调控临床研究多达8项，都来自欧美等治疗中心。我国2014年国家高技术研究发展计划(863计划)，将DOC的电磁刺激促醒治疗作为重点资助的研究内容，说明神经调控是DOC治疗的主要研究热点及方向之一，已是国内外的共识。尽管神经调控技术是未来DOC治疗的趋势明显，但目前均处于前期、小样本的试验研究，作为意识障碍临床治疗方式前，进行系统性、大样本、多中心的研究，突破诸多技术难题是必要的。
脑网络是用以深入理解脑功能的工作机制和脑疾病的唯一途径。2010年美国、欧洲、日本启动了人脑神经网络组计划，2010年我国也将脑网络研究确定为研究重点。因此，真正全面、科学、深入的DOC研究，应该是建立在脑网络分析的基础上，基于多模态神经影像及EEG两种方式的结合，提高神经调控对DOC疾病诊治中的认识和作用。
神经调控治疗在我国开展具有人口优势，不存在病例积累困难、研究进度缓慢的不足。这都将有利于率先突破神经调控治疗技术的瓶颈，推动该技术在临床的应用，培养该领域具有国际领先水平的人才和科研队伍。
